75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3971 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  100 
 
 		 468 aa  904    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  56.06 
 
 		 531 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  44.47 
 
 		 463 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  43.18 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  42.53 
 
 		 459 aa  312  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  43.15 
 
 		 460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  40.77 
 
 		 443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  44.16 
 
 		 482 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  41.69 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  42.82 
 
 		 444 aa  296  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  41.96 
 
 		 477 aa  286  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  41.19 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  39.95 
 
 		 443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  40.37 
 
 		 468 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  36.93 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  38.3 
 
 		 477 aa  250  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  36.04 
 
 		 449 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  34 
 
 		 490 aa  239  6.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  39.34 
 
 		 484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  31.59 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  35.29 
 
 		 468 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  34.14 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  34.14 
 
 		 447 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  34.14 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  39.96 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  39.96 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  39.96 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  30.89 
 
 		 441 aa  223  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  34.11 
 
 		 446 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 		 445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  30.88 
 
 		 453 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 		 446 aa  212  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  35.65 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  33.05 
 
 		 471 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  33.48 
 
 		 460 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  32.42 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  35.15 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  37.27 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  29.55 
 
 		 457 aa  187  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  31.89 
 
 		 449 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  33.03 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  32.95 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  39.15 
 
 		 447 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  32.88 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  32.88 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  35.64 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  36.64 
 
 		 471 aa  171  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  29.44 
 
 		 508 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  26.41 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  26.41 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  26.3 
 
 		 440 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  29.84 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  26.41 
 
 		 440 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  25.45 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  25.17 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  25.45 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  25.45 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  25.8 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.04 
 
 		 844 aa  154  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  33.81 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  28.64 
 
 		 839 aa  150  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  25.17 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 472 aa  130  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  28.88 
 
 		 509 aa  117  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  27.78 
 
 		 497 aa  110  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  29.3 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>