76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0613 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  99.57 
 
 
460 aa  919    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  921    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  921    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  49.44 
 
 
458 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  44.47 
 
 
444 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  42.46 
 
 
460 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  43.83 
 
 
482 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  41.26 
 
 
459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  40.84 
 
 
463 aa  280  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  41.63 
 
 
443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  40.77 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  36.26 
 
 
469 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  41.14 
 
 
484 aa  272  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  40.54 
 
 
460 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  40.14 
 
 
462 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  40.14 
 
 
462 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  39.67 
 
 
462 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  41.39 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  39.96 
 
 
443 aa  259  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  38.44 
 
 
449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  36.32 
 
 
449 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  35.09 
 
 
471 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  37.39 
 
 
477 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  39.04 
 
 
447 aa  240  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  34.77 
 
 
468 aa  239  8e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  37.56 
 
 
468 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  37.04 
 
 
462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  39.96 
 
 
468 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
531 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  36.36 
 
 
490 aa  229  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  35.07 
 
 
447 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  37.56 
 
 
463 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  35.29 
 
 
436 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  32.25 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  33.41 
 
 
457 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  31.14 
 
 
447 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  31.14 
 
 
447 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  33.11 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  31.14 
 
 
476 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  37.82 
 
 
447 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  31.75 
 
 
452 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  32.72 
 
 
558 aa  194  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  30.44 
 
 
508 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  31.65 
 
 
460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  27.49 
 
 
440 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  27.49 
 
 
440 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  37.17 
 
 
487 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  35.83 
 
 
460 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  28.23 
 
 
440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  27.05 
 
 
440 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  27.31 
 
 
440 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  31.93 
 
 
446 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  27.13 
 
 
440 aa  180  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  27.83 
 
 
440 aa  181  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  34.51 
 
 
468 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  26.83 
 
 
440 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  26.54 
 
 
440 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  26.05 
 
 
440 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  34.76 
 
 
471 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  37.16 
 
 
445 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.73 
 
 
844 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  29.53 
 
 
839 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  35.57 
 
 
446 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
472 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  34.16 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 
469 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 
476 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 
500 aa  73.2  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  26 
 
 
497 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  28.38 
 
 
437 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  57.89 
 
 
235 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  26.72 
 
 
490 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3720  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 
372 aa  51.6  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  22.8 
 
 
411 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
518 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  27.96 
 
 
416 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>