71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4064 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
469 aa  938    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  29.77 
 
 
469 aa  210  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  34.65 
 
 
484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  34.61 
 
 
460 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  33.85 
 
 
460 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 
471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  31.88 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
447 aa  171  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  40.77 
 
 
445 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  32.73 
 
 
459 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  30.82 
 
 
463 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  29.6 
 
 
443 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  29.73 
 
 
449 aa  160  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 
457 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  30.47 
 
 
436 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  29.5 
 
 
462 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  29.5 
 
 
462 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  27.38 
 
 
453 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  31.57 
 
 
482 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  29.98 
 
 
462 aa  156  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  28.51 
 
 
458 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  30.34 
 
 
460 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  30.69 
 
 
531 aa  150  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  31.26 
 
 
460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  28.34 
 
 
440 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  28.34 
 
 
440 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  28.66 
 
 
462 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 
477 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  26.96 
 
 
441 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  27.66 
 
 
440 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  29.79 
 
 
452 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  27.79 
 
 
440 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  28.48 
 
 
447 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  28.48 
 
 
447 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  28.48 
 
 
476 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  27.44 
 
 
440 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  31.15 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  30.43 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  27.95 
 
 
440 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  30.62 
 
 
463 aa  140  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  31.15 
 
 
460 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  31.15 
 
 
460 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  29.21 
 
 
440 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  29.29 
 
 
468 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  28.92 
 
 
440 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  27.38 
 
 
440 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  30.27 
 
 
446 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  32.74 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  30.73 
 
 
477 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  26.82 
 
 
440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  28.88 
 
 
490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  28.67 
 
 
447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  29.59 
 
 
468 aa  127  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  28.02 
 
 
449 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  29.23 
 
 
509 aa  123  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  29.8 
 
 
558 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  30.43 
 
 
468 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  27.09 
 
 
508 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  28.95 
 
 
468 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  30.58 
 
 
471 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.29 
 
 
844 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  28.16 
 
 
487 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  25.07 
 
 
839 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
472 aa  70.1  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  32.2 
 
 
497 aa  67  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  32.87 
 
 
518 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
500 aa  57  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  56.25 
 
 
235 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>