76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01754 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  100 
 
 		 497 aa  984    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 		 518 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 500 aa  160  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  30.87 
 
 		 490 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 476 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 437 aa  129  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  28.43 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.84 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  29.16 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  28.73 
 
 		 460 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  28.57 
 
 		 443 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  29.72 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  34.06 
 
 		 460 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  29.98 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  28.03 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 447 aa  98.2  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  26.24 
 
 		 447 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  29.46 
 
 		 484 aa  97.1  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  26.24 
 
 		 447 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  26.24 
 
 		 476 aa  96.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  24.62 
 
 		 469 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  26.54 
 
 		 440 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  26.26 
 
 		 440 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  26.26 
 
 		 440 aa  93.6  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  26.46 
 
 		 440 aa  93.6  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  26.54 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  25.43 
 
 		 453 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  25.98 
 
 		 440 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  28.93 
 
 		 482 aa  90.5  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  25.7 
 
 		 440 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  31.21 
 
 		 509 aa  89.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  26.72 
 
 		 490 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  24.26 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  28.57 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  26.82 
 
 		 449 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  28.3 
 
 		 468 aa  88.6  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  28.69 
 
 		 477 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  24.86 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  26.43 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  26.65 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  27.55 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  24.3 
 
 		 440 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  27.04 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  28.25 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  26.65 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  24.34 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  23.85 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  27.37 
 
 		 460 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  27.73 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  28.48 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  24.09 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  27.18 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  31.61 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  25.77 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  24.5 
 
 		 462 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 469 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  25.46 
 
 		 458 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  24.08 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  26.12 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  26.12 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  26.12 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  25.27 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  23.71 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  25.94 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  25.94 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.83 
 
 		 844 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  25.25 
 
 		 839 aa  52  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  25.96 
 
 		 361 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>