152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4171 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  100 
 
 		 490 aa  977    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 		 518 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 500 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 		 476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  32.16 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  28.22 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  29.45 
 
 		 468 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  28.93 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  27.45 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  25.63 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  25.07 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  27.26 
 
 		 531 aa  76.6  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  29.91 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  29.12 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  29.82 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  28.85 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  29.08 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  28.37 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  26.32 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  28.21 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  27.43 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  24.86 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  27.2 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  28.24 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  27.61 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  28 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  24.23 
 
 		 508 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  28.69 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  26.75 
 
 		 476 aa  67  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  28.66 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  24.23 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  24.23 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  25.28 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  24.29 
 
 		 440 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  25.35 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  26.68 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  26.68 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  25.41 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  25.07 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  27.3 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  24.23 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  27.3 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  27.3 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  28.8 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  28.11 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  35.05 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  29.23 
 
 		 558 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  24.26 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  26.1 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  27 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  26.36 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  25.61 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  24.93 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  25.74 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.64 
 
 		 844 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  24.12 
 
 		 471 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  28.28 
 
 		 645 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  27.46 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  25.79 
 
 		 462 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  25.79 
 
 		 462 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  30.09 
 
 		 647 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2293  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02075  predicted oxidoreductase  37.93 
 
 		 412 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.93 
 
 		 412 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02034  hypothetical protein  37.93 
 
 		 412 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2441  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 412 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1502  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 412 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3278  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 412 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.598108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2280  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 412 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0825  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 412 aa  50.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  26.32 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2425  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2533  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0200812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2332  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2376  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2421  putative oxidoreductase  37.93 
 
 		 413 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.70845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  25.5 
 
 		 462 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2776  putative oxidoreductase  26.5 
 
 		 413 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2463  putative oxidoreductase  26.5 
 
 		 413 aa  47  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.53 
 
 		 1440 aa  47  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.72 
 
 		 1406 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  31.37 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  27.56 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2589  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  40.91 
 
 		 792 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.295963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  38.71 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2897  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  27.14 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0358307  normal  0.859236 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  38.71 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.57 
 
 		 1440 aa  45.8  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  27.56 
 
 		 499 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2662  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  52.94 
 
 		 658 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>