79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1042 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  937    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  45.19 
 
 		 460 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  45.39 
 
 		 463 aa  342  8e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  46.82 
 
 		 459 aa  341  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  45.02 
 
 		 443 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  45.33 
 
 		 460 aa  335  9e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  45.1 
 
 		 460 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  45.17 
 
 		 444 aa  333  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  45.04 
 
 		 531 aa  332  9e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  45.52 
 
 		 443 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  43.33 
 
 		 449 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  45.8 
 
 		 477 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  43.25 
 
 		 468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  43.43 
 
 		 458 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  43.35 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  44.16 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  39.39 
 
 		 468 aa  296  7e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  40.41 
 
 		 447 aa  286  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  43.05 
 
 		 460 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  43.05 
 
 		 460 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  43.05 
 
 		 460 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  39.33 
 
 		 490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  42.08 
 
 		 477 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  41.49 
 
 		 484 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  35.57 
 
 		 469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  38.32 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  34.17 
 
 		 441 aa  249  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  33.94 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  34.31 
 
 		 460 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  35.12 
 
 		 463 aa  232  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  31.97 
 
 		 476 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  42.26 
 
 		 446 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  32.05 
 
 		 447 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  32.05 
 
 		 447 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  37.68 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  34.86 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  35.08 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  34.86 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  39.04 
 
 		 471 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  34.47 
 
 		 471 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  30.58 
 
 		 440 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  31.33 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  28.99 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  30.67 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  30.67 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  30.44 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  30.8 
 
 		 440 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  29.19 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  35.43 
 
 		 462 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  28.92 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.04 
 
 		 844 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  32.18 
 
 		 446 aa  209  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  30.13 
 
 		 457 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  39.37 
 
 		 487 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  32.59 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  28.29 
 
 		 440 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  34.41 
 
 		 558 aa  194  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  35.56 
 
 		 460 aa  194  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  32.83 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  30.36 
 
 		 839 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 445 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  38.24 
 
 		 447 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  31.84 
 
 		 468 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 		 509 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 469 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 472 aa  140  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  28.93 
 
 		 497 aa  90.5  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  59.65 
 
 		 235 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 518 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  25.53 
 
 		 490 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  29.65 
 
 		 400 aa  47.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  28.51 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  29.02 
 
 		 409 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>