78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2498 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 500 aa  1021    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 518 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  29.1 
 
 		 490 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  30.54 
 
 		 497 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 447 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 447 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 437 aa  140  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  24.95 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  27.5 
 
 		 444 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  24.64 
 
 		 453 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  27.51 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  25.64 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  28.26 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  27.72 
 
 		 436 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  27.72 
 
 		 460 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  26.7 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  24.79 
 
 		 463 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  28.12 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  26.34 
 
 		 460 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  26.43 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  23.86 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.21 
 
 		 844 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  24.73 
 
 		 458 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  27.25 
 
 		 484 aa  80.1  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  26.02 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  25.37 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  25.87 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  25.27 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  25.07 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  25.27 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  27.69 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  25.47 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  22.42 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  23.65 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  26.5 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  24.95 
 
 		 443 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  23.1 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  25.11 
 
 		 452 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  24.42 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  23.18 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  29 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  27.56 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  27.56 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  24.8 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  24.87 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  23.47 
 
 		 839 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  22.8 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  26.42 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  25.37 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  24.47 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  27.56 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  24.87 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  26.55 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  21.85 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  24.55 
 
 		 490 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  23.19 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  21.46 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  23.19 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  23.19 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  24.21 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 		 531 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  24.93 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  25.82 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  24.68 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  26.39 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  24.75 
 
 		 509 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  30.61 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  30.61 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  30.61 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  23.73 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  58.33 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  43.9  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1019  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 572 aa  43.1  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.463707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>