130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5129 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5129  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 411 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  49.14 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1178  monooxygenase FAD-binding protein  42.76 
 
 		 436 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3653  monooxygenase FAD-binding  29.33 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4211  monooxygenase FAD-binding  31.11 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747744  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03119  putative transmembrane protein  29.79 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.886572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3959  monooxygenase FAD-binding  29.6 
 
 		 411 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3185  monooxygenase FAD-binding  26.82 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304651  hitchhiker  0.000303065 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11008  Squalene epoxidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q27PP1]  25.58 
 
 		 483 aa  83.2  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.606924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2294  monooxygenase, FAD-binding  27.61 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.539275  hitchhiker  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4487  monooxygenase FAD-binding  29.84 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1725  monooxygenase, FAD-binding  27.63 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.600174 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3109  monooxygenase FAD-binding  26.05 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2934  monooxygenase, FAD-binding  28.03 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  28.41 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.7 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  24.77 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.87 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  26.32 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.36 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  27.91 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  27.51 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  23.53 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  28.57 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  29.69 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.06 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  25.46 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  26.71 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  26.61 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  23.86 
 
 		 495 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  21.48 
 
 		 444 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  30.06 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  27.32 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  25.48 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  24.16 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 		 443 aa  51.2  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.7 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  24.43 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  21.51 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 423 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 434 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3829  hypothetical protein  25.22 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0254394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3477  hypothetical protein  26.98 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0862  hypothetical protein  25.22 
 
 		 406 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.108949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4239  monooxygenase FAD-binding  26.09 
 
 		 407 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0865  hypothetical protein  25.22 
 
 		 447 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  26.06 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3104  monooxygenase, FAD-binding  27.44 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  28.34 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3927  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  26.82 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.3 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.29 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  24.36 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  25.61 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.46 
 
 		 506 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0892  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  26.97 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  31.11 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  26.26 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01380  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.86 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  23.24 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  26.26 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  26.26 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  24.18 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 455 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 440 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2577  monooxygenase FAD-binding  26.01 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  26.26 
 
 		 428 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2163  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.72 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3184  tryptophan halogenase  24.32 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  24.66 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2256  FAD-binding monooxygenase  30.14 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  25.88 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  22.84 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1226  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  22.89 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  24.77 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.34 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  27.97 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2872  monooxygenase family protein  25 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2763  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.53 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  23.97 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>