85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3651 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
477 aa  944    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  57.05 
 
 
443 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  53.14 
 
 
459 aa  463  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  55.38 
 
 
463 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  49.12 
 
 
490 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  48.98 
 
 
468 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  48.17 
 
 
436 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  46.73 
 
 
444 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  45.8 
 
 
482 aa  353  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  43.6 
 
 
458 aa  317  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  42.01 
 
 
468 aa  312  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  43.38 
 
 
443 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  39.32 
 
 
460 aa  309  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  41.39 
 
 
460 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  41.39 
 
 
460 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  41.39 
 
 
460 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  36.9 
 
 
441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  37.4 
 
 
531 aa  282  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  38.89 
 
 
477 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  38.3 
 
 
449 aa  269  8e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  40.23 
 
 
460 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  39.86 
 
 
460 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  37.44 
 
 
463 aa  263  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  37.2 
 
 
468 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  35.55 
 
 
453 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  35.91 
 
 
447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  35.91 
 
 
447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  32.58 
 
 
469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  35.99 
 
 
476 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  32.89 
 
 
457 aa  253  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  31.59 
 
 
440 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  31.95 
 
 
440 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  30.91 
 
 
440 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  30.91 
 
 
440 aa  250  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  30.73 
 
 
440 aa  249  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  30.91 
 
 
440 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  31.36 
 
 
440 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  37.33 
 
 
447 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 
447 aa  246  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  30.61 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  30 
 
 
440 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  36.04 
 
 
484 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  30.96 
 
 
440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  32.47 
 
 
471 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  34.08 
 
 
462 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  34.08 
 
 
462 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  32.89 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
558 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  36.96 
 
 
471 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  34.01 
 
 
468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  34.3 
 
 
462 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  28.51 
 
 
508 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  31.85 
 
 
446 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  35.29 
 
 
449 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  36.08 
 
 
460 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  37.21 
 
 
446 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  33.41 
 
 
462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.06 
 
 
844 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  30.87 
 
 
839 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  29.24 
 
 
452 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  38.38 
 
 
447 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  31.81 
 
 
487 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  32.48 
 
 
509 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  29.45 
 
 
472 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  28.42 
 
 
497 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 
500 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 
518 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 
476 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 
437 aa  59.7  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  58 
 
 
235 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 
424 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0536  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4- benzoquinone hydroxylase UbiF  23.2 
 
 
385 aa  54.7  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2743  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
447 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.211141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2787  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 
447 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 
375 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  23.83 
 
 
423 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2773  FAD dependent oxidoreductase  25.39 
 
 
447 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.81 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  29.1 
 
 
416 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  27.96 
 
 
490 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  24.34 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 
431 aa  45.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  25.79 
 
 
460 aa  43.1  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>