73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6971 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  949    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  59.16 
 
 
436 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  54.32 
 
 
459 aa  481  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  54.34 
 
 
463 aa  476  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  50.45 
 
 
443 aa  443  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  48.98 
 
 
477 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  43.6 
 
 
490 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  44.77 
 
 
444 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  43.25 
 
 
482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  40.23 
 
 
460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  41.3 
 
 
443 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  39.13 
 
 
458 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  40.37 
 
 
468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  37.08 
 
 
531 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  37.87 
 
 
484 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  35.6 
 
 
441 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  38.29 
 
 
477 aa  258  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  40.23 
 
 
460 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  39.77 
 
 
460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  32.59 
 
 
469 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  34.87 
 
 
449 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  35.07 
 
 
468 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
447 aa  236  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  33.78 
 
 
463 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  37.78 
 
 
460 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  37.56 
 
 
460 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  37.56 
 
 
460 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  34.03 
 
 
447 aa  223  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  30.98 
 
 
440 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  31.7 
 
 
508 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  32.19 
 
 
453 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  30.75 
 
 
440 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  30.75 
 
 
440 aa  217  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  30.98 
 
 
440 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  30.75 
 
 
440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  31.29 
 
 
440 aa  216  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  31.03 
 
 
440 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  30.82 
 
 
440 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  31.53 
 
 
476 aa  212  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  31.53 
 
 
447 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  31.53 
 
 
447 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  35 
 
 
468 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  30.07 
 
 
440 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  30.04 
 
 
440 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  33.49 
 
 
558 aa  204  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  32.88 
 
 
460 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  35.96 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  35.96 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  32.11 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  30.37 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  35.17 
 
 
462 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  34.44 
 
 
449 aa  190  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  30.94 
 
 
471 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  35.02 
 
 
460 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  34.68 
 
 
462 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  32.2 
 
 
471 aa  182  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  32.03 
 
 
452 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 
447 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  30.56 
 
 
487 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.48 
 
 
844 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  33.24 
 
 
509 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  27.72 
 
 
839 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 
472 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  28.57 
 
 
497 aa  89  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  22.42 
 
 
500 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  24.01 
 
 
476 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 
518 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  26.92 
 
 
437 aa  60.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  26.4 
 
 
490 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  60.87 
 
 
235 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>