74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5094 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  933    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  45.19 
 
 		 482 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  44.5 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  42.76 
 
 		 463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  42.86 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  44.04 
 
 		 460 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  44.09 
 
 		 458 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  42.42 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1923  FAD dependent oxidoreductase  39.55 
 
 		 531 aa  323  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.674457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3971  putative phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  43.18 
 
 		 468 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163754  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  42.92 
 
 		 444 aa  319  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  41.76 
 
 		 449 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  40.84 
 
 		 443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6971  hypothetical protein  40.23 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  39.18 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  38.07 
 
 		 436 aa  302  9e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0613  hypothetical protein  42.46 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0600  hypothetical protein  42.46 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0494768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0591  hypothetical protein  42.46 
 
 		 460 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  39.78 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  39.32 
 
 		 477 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  35.12 
 
 		 441 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  38.98 
 
 		 484 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  33.86 
 
 		 469 aa  267  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7423  monooxygenase, FAD-binding  35.68 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  37.35 
 
 		 447 aa  259  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  38.94 
 
 		 447 aa  256  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3479  monooxygenase FAD-binding  37.35 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  38.07 
 
 		 463 aa  253  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  33.41 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  33.41 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  33.41 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  34.86 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  35.37 
 
 		 460 aa  240  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  31.24 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  30.77 
 
 		 440 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  30.54 
 
 		 440 aa  232  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  31.16 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  30.54 
 
 		 440 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  30.37 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  30.14 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  30.14 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  33.1 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  30.54 
 
 		 440 aa  226  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  30.3 
 
 		 440 aa  223  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1331  hypothetical protein  35.7 
 
 		 462 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1348  hypothetical protein  35.7 
 
 		 462 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.885775 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1367  hypothetical protein  36.4 
 
 		 462 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  31.56 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1470  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 446 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.662537  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4723  hypothetical protein  35.41 
 
 		 449 aa  210  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.486773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13283  hypothetical protein  35.42 
 
 		 462 aa  209  8e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.246672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0650  monooxygenase FAD-binding  36.45 
 
 		 487 aa  204  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0286  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 		 445 aa  197  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18660  FAD binding protein  35.43 
 
 		 468 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4178  monooxygenase, FAD-binding  33.72 
 
 		 558 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1538  monooxygenase FAD-binding  34.84 
 
 		 471 aa  193  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00900279  normal  0.975685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4135  monooxygenase FAD-binding  34.97 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  30.47 
 
 		 508 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4604  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 		 509 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.366392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0831  hypothetical protein  30.44 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.3 
 
 		 844 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  30.61 
 
 		 839 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4358  monooxygenase FAD-binding  32.37 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00255024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0513  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 472 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0165805  decreased coverage  0.000000367703 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4064  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.218745  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_003296  RS01754  putative signal peptide protein  28.73 
 
 		 497 aa  107  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.95051  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2498  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 500 aa  87  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.268478  hitchhiker  0.000580756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4116  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3863  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6664  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00617853  normal  0.854513 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4834  hypothetical protein  55.77 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4171  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain  26.39 
 
 		 490 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  30.32 
 
 		 507 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>