More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4003 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  79.93 
 
 
839 aa  1374    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
844 aa  1729    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2723  anthranilate dioxygenase reductase  40.48 
 
 
340 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32140  anthranilate dioxygenase reductase  40.77 
 
 
340 aa  251  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.01 
 
 
337 aa  223  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  37.01 
 
 
339 aa  220  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0913  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit BenC  38.28 
 
 
339 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.61 
 
 
929 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1825  hypothetical protein  31.01 
 
 
469 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0471  benzoate 1,2-dioxygenase, ferredoxin reductase component  36.47 
 
 
338 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4160  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.01 
 
 
962 aa  211  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.312376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  35.82 
 
 
336 aa  211  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.98 
 
 
848 aa  211  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1042  hypothetical protein  33.04 
 
 
482 aa  210  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  35.52 
 
 
336 aa  210  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0185  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  35.59 
 
 
339 aa  210  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2727  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  35.59 
 
 
339 aa  210  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1554  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  35.59 
 
 
339 aa  210  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0213  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  35.59 
 
 
339 aa  210  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821344  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1358  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  35.59 
 
 
339 aa  210  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710358  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1001  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  35.59 
 
 
339 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2583  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  35.59 
 
 
339 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1500  monooxygenase FAD-binding  30.61 
 
 
441 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2517  hypothetical protein  30.56 
 
 
440 aa  205  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2702  hypothetical protein  30.56 
 
 
440 aa  205  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.82 
 
 
336 aa  203  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.03 
 
 
335 aa  203  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0440223  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2721  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit  36.36 
 
 
337 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.82 
 
 
338 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.9 
 
 
340 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2478  hypothetical protein  30.34 
 
 
440 aa  201  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00689698  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.1 
 
 
350 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32110  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer component  36.36 
 
 
337 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6384  monooxygenase FAD-binding  32.35 
 
 
444 aa  199  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00239538 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2716  hypothetical protein  29.89 
 
 
440 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000407728 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1018  hypothetical protein  30.13 
 
 
468 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.61 
 
 
336 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.61 
 
 
336 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.831402  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3163  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.61 
 
 
336 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141012  normal  0.450185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  36.61 
 
 
881 aa  195  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.61 
 
 
881 aa  195  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.24 
 
 
338 aa  194  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2587  hypothetical protein  29.57 
 
 
440 aa  194  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.064334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.34 
 
 
881 aa  193  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2721  hypothetical protein  29.35 
 
 
440 aa  193  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.82 
 
 
342 aa  193  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2443  hypothetical protein  29.21 
 
 
440 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  34.03 
 
 
339 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.47 
 
 
337 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.94 
 
 
344 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1135  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
447 aa  192  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.24 
 
 
339 aa  191  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.82 
 
 
342 aa  191  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.71 
 
 
341 aa  190  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2708  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.91 
 
 
337 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2459  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.72 
 
 
352 aa  190  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109529  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4009  monooxygenase FAD-binding  31.67 
 
 
477 aa  187  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.29 
 
 
341 aa  187  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0830  monooxygenase FAD-binding  28.95 
 
 
453 aa  187  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.29 
 
 
340 aa  187  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.29 
 
 
340 aa  187  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  33.82 
 
 
340 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2768  hypothetical protein  29.57 
 
 
440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.19 
 
 
342 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.29 
 
 
340 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2323  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  35.33 
 
 
335 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2966  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  35.01 
 
 
337 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2099  monooxygenase FAD-binding  31.8 
 
 
463 aa  185  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1000  hypothetical protein  31.21 
 
 
460 aa  185  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.37 
 
 
340 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2731  hypothetical protein  28.99 
 
 
440 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00924641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4305  monooxygenase FAD-binding  31.21 
 
 
460 aa  183  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5692  hypothetical protein  28.15 
 
 
508 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.085115  normal  0.0485746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1187  monooxygenase FAD-binding protein  31.17 
 
 
463 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5929  hypothetical protein  31.35 
 
 
458 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4243  hypothetical protein  31.75 
 
 
449 aa  180  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.159627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2441  hypothetical protein  29.57 
 
 
440 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3995  hypothetical protein  30.24 
 
 
460 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0405  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.84 
 
 
350 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1179  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.38 
 
 
342 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173064  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  34.01 
 
 
348 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4956  monooxygenase, FAD-binding  31.01 
 
 
443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3651  monooxygenase FAD-binding  32.06 
 
 
477 aa  175  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0463097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1239  monooxygenase FAD-binding protein  31.13 
 
 
484 aa  174  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0140  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  34.88 
 
 
357 aa  174  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.347043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0829  monooxygenase FAD-binding  28.48 
 
 
457 aa  174  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0842  hypothetical protein  30.86 
 
 
443 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2622  monooxygenase FAD-binding protein  29.93 
 
 
447 aa  171  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5094  hypothetical protein  30.3 
 
 
460 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0849389  normal  0.895154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1359  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.56 
 
 
349 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000150243  hitchhiker  0.00000955183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1299  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.24 
 
 
928 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4410  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.91 
 
 
376 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.421266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2091  monooxygenase, FAD-binding  30.61 
 
 
436 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2710  monooxygenase, FAD-binding  28.31 
 
 
459 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1777  monooxygenase FAD-binding  29.44 
 
 
471 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1122  oxidoreductase  33.92 
 
 
340 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14183  normal  0.242287 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0217  hypothetical protein  26.15 
 
 
476 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1354  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.88 
 
 
360 aa  162  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1719  hypothetical protein  26.41 
 
 
447 aa  162  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129966  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1632  hypothetical protein  26.41 
 
 
447 aa  162  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>