More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6093 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
929 aa  1916    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  57.01 
 
 
336 aa  399  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  56.55 
 
 
336 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  55.62 
 
 
342 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  53.73 
 
 
336 aa  379  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  55.16 
 
 
339 aa  379  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  55.62 
 
 
342 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  55.26 
 
 
339 aa  379  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2721  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit  54.76 
 
 
337 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  54.6 
 
 
340 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0913  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit BenC  54.28 
 
 
339 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1371  oxidoreductase FAD-binding region  56.29 
 
 
881 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32110  toluate 1,2-dioxygenase electron transfer component  54.46 
 
 
337 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1389  oxidoreductase FAD-binding subunit  56.29 
 
 
881 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0387303  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  54.38 
 
 
340 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  55.12 
 
 
342 aa  373  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  54.98 
 
 
341 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  55.82 
 
 
881 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  54.68 
 
 
340 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  54.98 
 
 
341 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0185  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  54.01 
 
 
339 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0213  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  54.01 
 
 
339 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1001  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  54.01 
 
 
339 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0471  benzoate 1,2-dioxygenase, ferredoxin reductase component  54.6 
 
 
338 aa  369  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2370  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  54.46 
 
 
338 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1554  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  54.01 
 
 
339 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  54.08 
 
 
340 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2583  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  54.01 
 
 
339 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  53.71 
 
 
339 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1358  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  54.01 
 
 
339 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710358  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2727  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  54.01 
 
 
339 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  54.03 
 
 
335 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0440223  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  54.55 
 
 
337 aa  365  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1304  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  54.08 
 
 
340 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6526  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  54.08 
 
 
340 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2323  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  55.99 
 
 
335 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  57.31 
 
 
336 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3163  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  57.01 
 
 
336 aa  363  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141012  normal  0.450185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  57.01 
 
 
336 aa  362  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.831402  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4160  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  52.68 
 
 
962 aa  360  8e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.312376  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2708  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  56.72 
 
 
337 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  51.8 
 
 
848 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2966  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  54.79 
 
 
337 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  52.69 
 
 
338 aa  349  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1299  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  51.72 
 
 
928 aa  337  9e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1179  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50.6 
 
 
342 aa  331  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173064  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2723  anthranilate dioxygenase reductase  41.72 
 
 
340 aa  267  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32140  anthranilate dioxygenase reductase  41.94 
 
 
340 aa  266  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.45 
 
 
388 aa  209  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11966  oxygenase  35.57 
 
 
839 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.595898 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.23 
 
 
344 aa  200  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4003  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.61 
 
 
844 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.454074  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.31 
 
 
380 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.56 
 
 
420 aa  183  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2459  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.53 
 
 
352 aa  181  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109529  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  32.3 
 
 
418 aa  180  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1051  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.26 
 
 
337 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4983  cytochrome P450  34.29 
 
 
387 aa  179  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  30.08 
 
 
408 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.64 
 
 
350 aa  177  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.14 
 
 
392 aa  177  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  30.43 
 
 
405 aa  177  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1200  methane monooxygenase, C subunit  34.48 
 
 
348 aa  177  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  29.97 
 
 
411 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  34.75 
 
 
395 aa  177  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  32.34 
 
 
407 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  31.97 
 
 
413 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  32.9 
 
 
407 aa  174  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  30.21 
 
 
398 aa  174  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  30.67 
 
 
411 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.17 
 
 
411 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.17 
 
 
411 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  31.79 
 
 
407 aa  174  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  31.79 
 
 
407 aa  174  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1359  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.02 
 
 
349 aa  173  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000150243  hitchhiker  0.00000955183 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  29.03 
 
 
411 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  29.89 
 
 
411 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  30.92 
 
 
411 aa  173  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  31.34 
 
 
409 aa  173  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  30.67 
 
 
411 aa  172  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.67 
 
 
411 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  33.88 
 
 
404 aa  171  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1764  cytochrome P450  31.23 
 
 
390 aa  171  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  30.42 
 
 
411 aa  171  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  33.88 
 
 
404 aa  171  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  33.88 
 
 
404 aa  171  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  33.88 
 
 
404 aa  171  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  29.34 
 
 
411 aa  170  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  29.38 
 
 
411 aa  170  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.66 
 
 
410 aa  169  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  29.63 
 
 
426 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2659  cytochrome P450 family protein  33.15 
 
 
404 aa  168  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00743758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  30.17 
 
 
411 aa  168  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.42 
 
 
411 aa  168  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4160  cytochrome P450  33.05 
 
 
385 aa  168  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  29.44 
 
 
412 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  31.32 
 
 
406 aa  167  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  29.09 
 
 
419 aa  167  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4803  cytochrome P450  32.84 
 
 
394 aa  167  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.173439  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  32.88 
 
 
404 aa  167  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>