More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4362 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  100 
 
 
398 aa  804    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  44.55 
 
 
402 aa  319  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  44.61 
 
 
401 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  42.28 
 
 
411 aa  308  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  40.82 
 
 
410 aa  306  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  40.88 
 
 
405 aa  296  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  36.68 
 
 
411 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  46.19 
 
 
411 aa  292  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  36.18 
 
 
411 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  36.68 
 
 
411 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.43 
 
 
411 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  36.68 
 
 
411 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.93 
 
 
411 aa  290  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  43.35 
 
 
412 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  36.43 
 
 
411 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  36.43 
 
 
411 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  41.29 
 
 
426 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.43 
 
 
411 aa  289  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  36.18 
 
 
411 aa  289  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  42.25 
 
 
399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  37.59 
 
 
411 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  42.61 
 
 
402 aa  286  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  41.22 
 
 
405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  39.66 
 
 
408 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  41.73 
 
 
418 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.68 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  38.01 
 
 
407 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  40.81 
 
 
407 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  42.17 
 
 
410 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  43.41 
 
 
402 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  40.59 
 
 
400 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.5 
 
 
412 aa  271  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  43.09 
 
 
418 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  43.89 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  43.11 
 
 
406 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  40.05 
 
 
422 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  40.45 
 
 
429 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  40.25 
 
 
423 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  44.29 
 
 
392 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  39.56 
 
 
410 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34 
 
 
420 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  40.59 
 
 
414 aa  260  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  39.14 
 
 
405 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  44.72 
 
 
417 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  41.1 
 
 
388 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  40.28 
 
 
417 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  41.58 
 
 
407 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  41.58 
 
 
407 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  41.58 
 
 
407 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  41.27 
 
 
409 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  39.28 
 
 
380 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  38.7 
 
 
413 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  38.52 
 
 
439 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  39.95 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.12 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  39 
 
 
423 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  37.35 
 
 
442 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.88 
 
 
436 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  41.56 
 
 
417 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  41.48 
 
 
419 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  39.02 
 
 
414 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  38.14 
 
 
398 aa  250  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  42.72 
 
 
411 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  39.22 
 
 
413 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  41.46 
 
 
412 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  41.46 
 
 
412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  34.77 
 
 
411 aa  245  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  38.44 
 
 
409 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  41.02 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  38.08 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  34.77 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  39.24 
 
 
408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  38.44 
 
 
406 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  43.79 
 
 
417 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  39.39 
 
 
409 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  38.44 
 
 
399 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  40.77 
 
 
416 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  33.93 
 
 
411 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  36.2 
 
 
411 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.43 
 
 
400 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  38.68 
 
 
404 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  37.84 
 
 
406 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  37.63 
 
 
417 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.4 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  39.65 
 
 
404 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  38.76 
 
 
419 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  32.56 
 
 
411 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  37.19 
 
 
405 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  36.27 
 
 
398 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  38.9 
 
 
423 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.28 
 
 
417 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  36.34 
 
 
402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  36.91 
 
 
402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  41.76 
 
 
399 aa  236  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  37.47 
 
 
418 aa  236  6e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  39.07 
 
 
409 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  38.77 
 
 
405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1580  cytochrome P450  37.76 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0380124  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  37.81 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2811  cytochrome P450  36.87 
 
 
408 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>