More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2513 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  100 
 
 
419 aa  843    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  48.54 
 
 
412 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  42.43 
 
 
405 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  39.8 
 
 
420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  40.51 
 
 
411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  40.25 
 
 
411 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  40.25 
 
 
411 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  40.25 
 
 
411 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  40.76 
 
 
411 aa  323  5e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  40 
 
 
411 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  40 
 
 
411 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  40.1 
 
 
411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  39.75 
 
 
411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  39.85 
 
 
411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  44.99 
 
 
410 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  39.1 
 
 
411 aa  319  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  44.89 
 
 
411 aa  318  9e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  40.1 
 
 
411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.39 
 
 
412 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  43.28 
 
 
402 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  40.57 
 
 
417 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  39.57 
 
 
426 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.97 
 
 
401 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  42.37 
 
 
423 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  43.91 
 
 
410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  40.25 
 
 
408 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  41.48 
 
 
398 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.68 
 
 
408 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  39.64 
 
 
414 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  41.23 
 
 
410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.64 
 
 
400 aa  266  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  38.89 
 
 
396 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  40.25 
 
 
407 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  36.39 
 
 
420 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  40 
 
 
407 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  40 
 
 
407 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  40.05 
 
 
399 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  38.24 
 
 
405 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  39.11 
 
 
407 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.74 
 
 
398 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  40.5 
 
 
406 aa  257  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  38.37 
 
 
417 aa  255  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  38.35 
 
 
417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  37.87 
 
 
459 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  39.59 
 
 
412 aa  253  7e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.12 
 
 
402 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.29 
 
 
388 aa  249  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  39.02 
 
 
395 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  37.98 
 
 
395 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  36.43 
 
 
409 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  40.66 
 
 
418 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.67 
 
 
402 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.84 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  39.85 
 
 
414 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  38.26 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  37.04 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.42 
 
 
394 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  40 
 
 
416 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  37.53 
 
 
408 aa  242  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  38.14 
 
 
401 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  37.05 
 
 
380 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  40.41 
 
 
398 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  38.3 
 
 
391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  37.89 
 
 
406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  37.63 
 
 
400 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.71 
 
 
411 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  38.9 
 
 
406 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  38.9 
 
 
406 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  38.9 
 
 
406 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  38.5 
 
 
405 aa  239  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  35.66 
 
 
408 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  35.71 
 
 
412 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  36.21 
 
 
412 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  37.4 
 
 
400 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.86 
 
 
406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  37.56 
 
 
429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  35.79 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  37.63 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  36.14 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  36.11 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  41.07 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  36.25 
 
 
399 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  36.96 
 
 
403 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  35.42 
 
 
399 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  37.73 
 
 
400 aa  232  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  36.45 
 
 
404 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  36.29 
 
 
409 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  35.75 
 
 
417 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  35.15 
 
 
422 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  39.05 
 
 
402 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  37.93 
 
 
422 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  35.96 
 
 
421 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  35.55 
 
 
405 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  37.09 
 
 
407 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  37.92 
 
 
430 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  37.09 
 
 
407 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  38.44 
 
 
408 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  35.16 
 
 
400 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  35.49 
 
 
406 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  37.83 
 
 
464 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>