More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0765 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  86.53 
 
 
401 aa  705    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  100 
 
 
402 aa  807    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  43.67 
 
 
405 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  44.55 
 
 
398 aa  319  6e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  47.72 
 
 
410 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  40.49 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  44.94 
 
 
423 aa  298  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  43.53 
 
 
399 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  41.89 
 
 
411 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  40.45 
 
 
411 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  40.2 
 
 
411 aa  296  5e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  45.52 
 
 
411 aa  295  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  42.07 
 
 
407 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  39.65 
 
 
411 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  39.95 
 
 
411 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  39.95 
 
 
411 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  39.7 
 
 
411 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  39.7 
 
 
411 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  40.79 
 
 
410 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  39.7 
 
 
411 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  40 
 
 
411 aa  292  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  39.7 
 
 
411 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  42.71 
 
 
407 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  38.52 
 
 
420 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  42.71 
 
 
407 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  42.71 
 
 
407 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  41.03 
 
 
411 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  43.37 
 
 
417 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  42.68 
 
 
412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  41.29 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  42.25 
 
 
426 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  43.56 
 
 
412 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  40.2 
 
 
412 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  42.11 
 
 
429 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  43.28 
 
 
419 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  42.86 
 
 
417 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  39.7 
 
 
412 aa  279  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  41.62 
 
 
388 aa  278  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  42.12 
 
 
402 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  39.45 
 
 
411 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  40.15 
 
 
413 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  41.65 
 
 
405 aa  276  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  43.53 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  42.21 
 
 
410 aa  273  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  42.89 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  39.71 
 
 
429 aa  272  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  40.1 
 
 
413 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  41.41 
 
 
408 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  42.11 
 
 
414 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  43.24 
 
 
407 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  41.52 
 
 
400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  41.28 
 
 
419 aa  269  7e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  37.97 
 
 
402 aa  268  8e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  40.87 
 
 
405 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  40.82 
 
 
417 aa  265  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  39.54 
 
 
407 aa  265  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  37.72 
 
 
402 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  41.46 
 
 
405 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  41.44 
 
 
406 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  38.64 
 
 
399 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  41 
 
 
417 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  43.23 
 
 
408 aa  262  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  39.5 
 
 
402 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  41.77 
 
 
406 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  42.39 
 
 
427 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  43.68 
 
 
417 aa  259  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  41.98 
 
 
416 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  39.04 
 
 
436 aa  256  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  41.06 
 
 
409 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  41.44 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  40.77 
 
 
392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  39.02 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  43.48 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  36.34 
 
 
398 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  42.24 
 
 
404 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  40.8 
 
 
414 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  41.69 
 
 
423 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  37.47 
 
 
400 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  45.63 
 
 
421 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  41.39 
 
 
400 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  39.05 
 
 
406 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.75 
 
 
400 aa  249  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  40.92 
 
 
402 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  43.01 
 
 
409 aa  249  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  38.75 
 
 
418 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  37.88 
 
 
399 aa  249  7e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  42.03 
 
 
450 aa  249  8e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  37.32 
 
 
413 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  33.41 
 
 
411 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  37.94 
 
 
417 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  39.44 
 
 
408 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  44.19 
 
 
423 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  37.64 
 
 
380 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  39.39 
 
 
409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  38.57 
 
 
405 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  33.17 
 
 
408 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  34.19 
 
 
411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  39.55 
 
 
408 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  37.44 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  34.19 
 
 
411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>