More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1843 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  100 
 
 
403 aa  815    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  50.62 
 
 
408 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  49.27 
 
 
408 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  49.76 
 
 
416 aa  381  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  49.38 
 
 
407 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  52.23 
 
 
409 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  49.37 
 
 
405 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  50 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  45.48 
 
 
424 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  47.07 
 
 
398 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  49.49 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  46.78 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  44.25 
 
 
409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  47.07 
 
 
395 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  45 
 
 
400 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  44.15 
 
 
407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  44.15 
 
 
408 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  44.94 
 
 
409 aa  325  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  43.52 
 
 
404 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  44.44 
 
 
409 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  42.79 
 
 
401 aa  318  7.999999999999999e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  44.31 
 
 
401 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  43.56 
 
 
404 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  43.84 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  43.4 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  43.29 
 
 
411 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  42.51 
 
 
410 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  42.82 
 
 
400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  44.74 
 
 
412 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  44.74 
 
 
412 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  43.53 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  43.53 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  44.78 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  44.47 
 
 
412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  42.64 
 
 
399 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  41.19 
 
 
415 aa  299  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  41.56 
 
 
406 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  43.07 
 
 
410 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  40.63 
 
 
401 aa  295  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  41.83 
 
 
421 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  41.83 
 
 
421 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  41.83 
 
 
421 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  40.74 
 
 
399 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  41.9 
 
 
408 aa  293  5e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  42.93 
 
 
400 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  40.81 
 
 
415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  41.28 
 
 
405 aa  279  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  43.37 
 
 
406 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  43.37 
 
 
406 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  43.37 
 
 
406 aa  279  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  38.33 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  40 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  40 
 
 
436 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  45.77 
 
 
357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  39.51 
 
 
407 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  42.75 
 
 
406 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  41.39 
 
 
406 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  40.1 
 
 
414 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  40 
 
 
402 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  39.85 
 
 
409 aa  262  8.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  39.44 
 
 
400 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  39.95 
 
 
402 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  39.08 
 
 
375 aa  258  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  39.36 
 
 
398 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.08 
 
 
412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  42.9 
 
 
345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  38.89 
 
 
399 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  38.67 
 
 
405 aa  250  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.88 
 
 
405 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  40.56 
 
 
394 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  39.01 
 
 
401 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  40.19 
 
 
397 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  39.95 
 
 
394 aa  248  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  38.5 
 
 
391 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  36.88 
 
 
397 aa  245  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  38 
 
 
400 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  39.28 
 
 
408 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  37.31 
 
 
405 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  37.97 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  39.9 
 
 
395 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  39.02 
 
 
388 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.79 
 
 
419 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.56 
 
 
411 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.47 
 
 
395 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  33.99 
 
 
395 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  36.74 
 
 
423 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  37.47 
 
 
404 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  37.5 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  38.3 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  38.11 
 
 
406 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.95 
 
 
410 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  36.71 
 
 
403 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.8 
 
 
406 aa  219  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  38.23 
 
 
403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.82 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.66 
 
 
400 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  39.4 
 
 
397 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.34 
 
 
411 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  36.2 
 
 
423 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.17 
 
 
420 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>