More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2290 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  100 
 
 		 400 aa  795    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  47.98 
 
 		 412 aa  329  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  42.71 
 
 		 396 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.52 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  45.66 
 
 		 411 aa  291  9e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  42.2 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  45.69 
 
 		 406 aa  286  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  45.71 
 
 		 418 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  43.78 
 
 		 400 aa  282  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  43.51 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  35.8 
 
 		 420 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.65 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  42.26 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  40.59 
 
 		 398 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.38 
 
 		 411 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.61 
 
 		 411 aa  272  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  35.1 
 
 		 411 aa  272  9e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  40.16 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  35.38 
 
 		 411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.52 
 
 		 402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  35.38 
 
 		 411 aa  269  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  34.85 
 
 		 411 aa  269  8e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.1 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  35.58 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35.1 
 
 		 411 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.1 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.1 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.76 
 
 		 402 aa  263  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  40.46 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  39.09 
 
 		 420 aa  255  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  40.76 
 
 		 414 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.03 
 
 		 412 aa  252  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  41.13 
 
 		 410 aa  248  9e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  36.22 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.07 
 
 		 417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  39.6 
 
 		 423 aa  242  9e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  40.84 
 
 		 414 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  39.49 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  39.23 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  39.12 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.3 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  39.22 
 
 		 421 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  38.05 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  39.29 
 
 		 407 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37.38 
 
 		 407 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  36.13 
 
 		 380 aa  232  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  39.43 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  38.97 
 
 		 411 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.84 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  39.04 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  39.04 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  36.76 
 
 		 408 aa  229  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.99 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  36.32 
 
 		 400 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.94 
 
 		 436 aa  226  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  37.6 
 
 		 407 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  37.6 
 
 		 407 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  38.35 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  35.51 
 
 		 408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  39.15 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  36.92 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  36.92 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  36.92 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  37.89 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  35.64 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  35.92 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  38.85 
 
 		 402 aa  221  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.72 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  36.61 
 
 		 405 aa  219  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  36.55 
 
 		 400 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  37.6 
 
 		 400 aa  219  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  35.96 
 
 		 401 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  37.4 
 
 		 388 aa  219  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.44 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  39.02 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  37.22 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  35.77 
 
 		 399 aa  215  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  36.57 
 
 		 406 aa  215  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  36.55 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  35.07 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  34.81 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  40.39 
 
 		 357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  35.08 
 
 		 395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  35.34 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.32 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  34.83 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  40.6 
 
 		 390 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.4 
 
 		 408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  38.4 
 
 		 419 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  36.46 
 
 		 402 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  36.08 
 
 		 410 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  36.78 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  35.31 
 
 		 421 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  37.11 
 
 		 400 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  40.21 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  36.22 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  36.43 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  37.06 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  35.78 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  36.01 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>