More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4481 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  95.86 
 
 		 412 aa  800    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  94.65 
 
 		 412 aa  790    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  100 
 
 		 411 aa  828    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  65.46 
 
 		 413 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  64.98 
 
 		 417 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  62.56 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  60.53 
 
 		 417 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  60.29 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  53.46 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  49.09 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0401  cytochrome P450  42.72 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.55 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  39.45 
 
 		 402 aa  276  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  40.29 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  39.36 
 
 		 407 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  39.36 
 
 		 407 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  39.36 
 
 		 407 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.62 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  38.73 
 
 		 419 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  37.23 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  41.18 
 
 		 411 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  42.72 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  36.74 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  37.68 
 
 		 427 aa  243  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.7 
 
 		 411 aa  242  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.59 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  35.82 
 
 		 420 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  39.14 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.05 
 
 		 410 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.84 
 
 		 412 aa  240  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  36.93 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.52 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  42.81 
 
 		 411 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.2 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  40.84 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  43.55 
 
 		 411 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.69 
 
 		 399 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  43.21 
 
 		 411 aa  232  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  43.21 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  43.21 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  43.21 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  42.51 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  42.86 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  42.86 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.88 
 
 		 410 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  37.86 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.58 
 
 		 408 aa  229  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  35.64 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.11 
 
 		 417 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.64 
 
 		 406 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.48 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.91 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  34.65 
 
 		 411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.71 
 
 		 419 aa  222  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  35.17 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.24 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  36.64 
 
 		 423 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  38.8 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.49 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  36.43 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  35.42 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.64 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  36.12 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.73 
 
 		 426 aa  219  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  37.43 
 
 		 459 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  33.9 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  37.63 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.78 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.25 
 
 		 407 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.97 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  33.33 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  34.3 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.32 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  31.5 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  34.72 
 
 		 408 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  35.91 
 
 		 402 aa  212  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  34.02 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  41.8 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.44 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  33.75 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.69 
 
 		 405 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  36.62 
 
 		 464 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  35.82 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  40 
 
 		 402 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  41.12 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  34.07 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.56 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  33.6 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.24 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  31.31 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  35.81 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  35.57 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  34.24 
 
 		 418 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.06 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  32 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  42.24 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  31.81 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  36.18 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  34.88 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  40.07 
 
 		 408 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>