More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1860 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  100 
 
 		 459 aa  918    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  48.26 
 
 		 411 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  40.69 
 
 		 405 aa  289  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  37.79 
 
 		 420 aa  279  8e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  40.31 
 
 		 412 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.82 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  41.08 
 
 		 410 aa  266  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.3 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  38.56 
 
 		 426 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.66 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  46.2 
 
 		 401 aa  250  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.66 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.87 
 
 		 419 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  36.68 
 
 		 411 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  36.68 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  42.86 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  37.08 
 
 		 411 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.65 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  40.64 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  36.81 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.65 
 
 		 411 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.88 
 
 		 411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  36.55 
 
 		 411 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  36.55 
 
 		 411 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  38.5 
 
 		 412 aa  242  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.45 
 
 		 406 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  38 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  45.68 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.77 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  37.97 
 
 		 412 aa  236  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  43.26 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  38.06 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  40.25 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.78 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.47 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  37.43 
 
 		 411 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  39.71 
 
 		 423 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.65 
 
 		 429 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.26 
 
 		 401 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  37.4 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.66 
 
 		 410 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  35.48 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  38.6 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.09 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  41.95 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  41.95 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  41.95 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.08 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36.75 
 
 		 399 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  42.44 
 
 		 423 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  37.87 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  40 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  41.19 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  36.53 
 
 		 423 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  40.31 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.07 
 
 		 400 aa  213  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  35.31 
 
 		 408 aa  213  7.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  37.71 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  40.35 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  35.55 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  36.61 
 
 		 408 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  41.4 
 
 		 414 aa  210  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  34.75 
 
 		 436 aa  209  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  40.88 
 
 		 421 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  36.91 
 
 		 402 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  34.81 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  35.71 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  37.28 
 
 		 409 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  44.21 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.34 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  41.92 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  38.02 
 
 		 410 aa  207  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  36.27 
 
 		 409 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.62 
 
 		 395 aa  206  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  35.94 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.61 
 
 		 409 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  36.75 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  35.96 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  40.13 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.19 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  36.59 
 
 		 400 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  35.22 
 
 		 405 aa  203  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  38.74 
 
 		 399 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  38.04 
 
 		 410 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  32.23 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  36.98 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  35.43 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  36.39 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  36.32 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  33.67 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  32.66 
 
 		 402 aa  199  7.999999999999999e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36.9 
 
 		 392 aa  199  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.17 
 
 		 417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  37.57 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.71 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  35.26 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  35.94 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  39.63 
 
 		 406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  34.56 
 
 		 402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  32.23 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>