More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4934 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  100 
 
 
405 aa  817    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  60.9 
 
 
408 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  60.15 
 
 
409 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  54.64 
 
 
407 aa  434  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  51.51 
 
 
407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  48.37 
 
 
409 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  47.87 
 
 
409 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  48.15 
 
 
400 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  49.37 
 
 
403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  47.62 
 
 
408 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  47.62 
 
 
416 aa  352  8e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  45.93 
 
 
412 aa  349  6e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  45.93 
 
 
412 aa  349  6e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  45.68 
 
 
412 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  47.75 
 
 
398 aa  346  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  46.77 
 
 
421 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  46.77 
 
 
421 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  46.77 
 
 
421 aa  342  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  45.48 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  47.04 
 
 
395 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  46.19 
 
 
401 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  49.47 
 
 
400 aa  325  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  46.65 
 
 
399 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  47.87 
 
 
401 aa  323  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  45.11 
 
 
410 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  44.64 
 
 
406 aa  318  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  45.75 
 
 
404 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  43.46 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  43.86 
 
 
407 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  41.09 
 
 
409 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  44.14 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  43.5 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  43.5 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  44.04 
 
 
415 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  44.53 
 
 
408 aa  299  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  43.58 
 
 
400 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  46.52 
 
 
410 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  44.2 
 
 
430 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  44.42 
 
 
400 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  43.35 
 
 
414 aa  292  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  45.01 
 
 
399 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  40 
 
 
424 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  42.89 
 
 
399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  43.45 
 
 
436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  42.86 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  43.36 
 
 
402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  42.44 
 
 
406 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  42.89 
 
 
406 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  42.89 
 
 
406 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  42.89 
 
 
406 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  40.8 
 
 
415 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  41.4 
 
 
400 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  41.73 
 
 
421 aa  279  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  41.31 
 
 
411 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  41.85 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  43.21 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  43.03 
 
 
406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  40.69 
 
 
404 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  41.43 
 
 
405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  42.64 
 
 
409 aa  269  7e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  41.04 
 
 
399 aa  269  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  39.95 
 
 
391 aa  266  4e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  38.9 
 
 
407 aa  265  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  41.24 
 
 
394 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  38.12 
 
 
401 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  39.67 
 
 
375 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  43.59 
 
 
345 aa  257  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  40.05 
 
 
402 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  37.56 
 
 
405 aa  255  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  42.06 
 
 
398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  46.33 
 
 
357 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  41.3 
 
 
398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  40 
 
 
395 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.82 
 
 
408 aa  243  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  38.57 
 
 
397 aa  242  7e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  39.19 
 
 
401 aa  242  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  40.51 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  40 
 
 
399 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.62 
 
 
412 aa  236  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  37.79 
 
 
404 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  37.9 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  37.44 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.39 
 
 
410 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  38.25 
 
 
412 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  37.63 
 
 
403 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  36.5 
 
 
417 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  38.18 
 
 
423 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  36.16 
 
 
395 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  34.88 
 
 
388 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  38.4 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.08 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.55 
 
 
419 aa  219  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.34 
 
 
411 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  37.53 
 
 
406 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.63 
 
 
426 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13141  cytochrome P450 141 cyp141  34.66 
 
 
400 aa  216  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.170339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  37.69 
 
 
403 aa  216  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.24 
 
 
414 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  35.73 
 
 
423 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.14 
 
 
400 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>