More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4927 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  89.6 
 
 
403 aa  736    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  100 
 
 
404 aa  820    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  67.73 
 
 
406 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  69.14 
 
 
403 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  63.22 
 
 
401 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  41.18 
 
 
394 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  41.75 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  39.8 
 
 
425 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  43.08 
 
 
391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  40.25 
 
 
399 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  38.57 
 
 
395 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  40.24 
 
 
402 aa  252  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  38.48 
 
 
402 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.02 
 
 
395 aa  247  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  39.65 
 
 
398 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.36 
 
 
411 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  39.49 
 
 
400 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  37.79 
 
 
405 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  40.75 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.34 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  36.61 
 
 
395 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  37.1 
 
 
408 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  36.93 
 
 
404 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  36.5 
 
 
399 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  37.04 
 
 
393 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.36 
 
 
412 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.59 
 
 
405 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  37.57 
 
 
404 aa  227  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  37.38 
 
 
409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.9 
 
 
406 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.13 
 
 
412 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.45 
 
 
419 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.17 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.06 
 
 
426 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  36.59 
 
 
409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.8 
 
 
408 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  34.84 
 
 
408 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  35.88 
 
 
399 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  36.25 
 
 
406 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  36.25 
 
 
406 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  36.25 
 
 
406 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  37.47 
 
 
403 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  37.34 
 
 
399 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  37.19 
 
 
430 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  35.87 
 
 
421 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  34.31 
 
 
409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  37 
 
 
408 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  37.56 
 
 
423 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  35.89 
 
 
407 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.59 
 
 
420 aa  216  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  37.99 
 
 
407 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  37.99 
 
 
407 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.16 
 
 
388 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  34.79 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  35.9 
 
 
400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  36.05 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  38.99 
 
 
410 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  35.48 
 
 
459 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.15 
 
 
394 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  38.19 
 
 
410 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  37.31 
 
 
400 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  36.9 
 
 
401 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  36.2 
 
 
405 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  34.07 
 
 
409 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  36.46 
 
 
436 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  35.28 
 
 
406 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.03 
 
 
411 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  39.94 
 
 
357 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  37.83 
 
 
450 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  35.18 
 
 
411 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  34.74 
 
 
411 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  35.16 
 
 
411 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  37.66 
 
 
345 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  34.67 
 
 
423 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  35.19 
 
 
407 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.32 
 
 
400 aa  203  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.68 
 
 
411 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.68 
 
 
411 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.68 
 
 
411 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  36.96 
 
 
410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.9 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  32.19 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  34.26 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  34.78 
 
 
414 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  35.53 
 
 
421 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  33.66 
 
 
401 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  34.25 
 
 
408 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  34.62 
 
 
411 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13141  cytochrome P450 141 cyp141  30.73 
 
 
400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.170339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.33 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  33.07 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  33.07 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.33 
 
 
411 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  33.5 
 
 
398 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.41 
 
 
410 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  33.25 
 
 
409 aa  196  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  34.43 
 
 
398 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  33.77 
 
 
422 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>