More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2802 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  100 
 
 
409 aa  835    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  56.93 
 
 
416 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  45.05 
 
 
408 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  41.44 
 
 
416 aa  316  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  43.42 
 
 
412 aa  317  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  45.05 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  42.33 
 
 
409 aa  310  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  42.33 
 
 
367 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  40.79 
 
 
409 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  41.78 
 
 
373 aa  278  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  36.16 
 
 
424 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  39.27 
 
 
412 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  41.19 
 
 
400 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1257  cytochrome P450 monooxygenase  38.5 
 
 
396 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  38.58 
 
 
417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.82 
 
 
405 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.72 
 
 
412 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.7 
 
 
410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  38.65 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.43 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.24 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  35.62 
 
 
411 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.61 
 
 
411 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  36.41 
 
 
411 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  35.09 
 
 
411 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.61 
 
 
411 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.65 
 
 
411 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.43 
 
 
402 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  36.34 
 
 
411 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  36.34 
 
 
411 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.5 
 
 
406 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.88 
 
 
411 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  36.07 
 
 
411 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.7 
 
 
411 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.19 
 
 
400 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  37.59 
 
 
423 aa  226  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.48 
 
 
402 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.07 
 
 
411 aa  219  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  35.66 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.62 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  35.69 
 
 
418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  37.81 
 
 
401 aa  213  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  36.63 
 
 
398 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  33.42 
 
 
417 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  36.34 
 
 
398 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  34.56 
 
 
420 aa  209  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  36.05 
 
 
407 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  36.05 
 
 
407 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.95 
 
 
426 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.89 
 
 
394 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  37.03 
 
 
382 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  34.05 
 
 
399 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  36.43 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  36.86 
 
 
436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  37.53 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  35.77 
 
 
399 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.86 
 
 
399 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.38 
 
 
401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  36.94 
 
 
417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  34.03 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  35.63 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  35.42 
 
 
401 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  37.4 
 
 
410 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  32.75 
 
 
396 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.38 
 
 
420 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  31.65 
 
 
400 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  34.26 
 
 
395 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  37.78 
 
 
406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  32.4 
 
 
416 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  40.43 
 
 
423 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  35.47 
 
 
376 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  34.97 
 
 
395 aa  189  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  33.33 
 
 
398 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  34.33 
 
 
414 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  34.47 
 
 
402 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  35.98 
 
 
407 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  32.84 
 
 
388 aa  187  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  34.2 
 
 
375 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  35.98 
 
 
407 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  35.98 
 
 
407 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3894  cytochrome P450  35.59 
 
 
403 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  34.62 
 
 
399 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  39.8 
 
 
406 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  39.8 
 
 
406 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  39.8 
 
 
406 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  32.55 
 
 
391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  33.59 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  36.94 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  35.43 
 
 
429 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  36.86 
 
 
395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  33.5 
 
 
402 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  33.16 
 
 
408 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  33.5 
 
 
402 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  33.5 
 
 
402 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  33.07 
 
 
400 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  37.07 
 
 
402 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  34.03 
 
 
400 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  36.05 
 
 
419 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  35.64 
 
 
405 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  30.67 
 
 
401 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>