More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3938 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  100 
 
 
417 aa  828    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  50.84 
 
 
416 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  45.91 
 
 
405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  46.25 
 
 
423 aa  316  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  45.92 
 
 
414 aa  305  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  44.22 
 
 
429 aa  299  6e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  42.32 
 
 
427 aa  273  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.78 
 
 
405 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41 
 
 
402 aa  262  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  40.28 
 
 
398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.62 
 
 
401 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.04 
 
 
411 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  40.74 
 
 
407 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  40.74 
 
 
407 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  40.74 
 
 
407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  38.52 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  39.13 
 
 
399 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.66 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.94 
 
 
410 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33 
 
 
411 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33 
 
 
411 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.18 
 
 
419 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  33 
 
 
411 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.11 
 
 
410 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.76 
 
 
402 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  37.83 
 
 
405 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.86 
 
 
412 aa  229  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.75 
 
 
411 aa  229  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.01 
 
 
420 aa  226  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.61 
 
 
412 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33 
 
 
411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  39.14 
 
 
417 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  38.35 
 
 
412 aa  222  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  31.91 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  38.81 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  36.45 
 
 
417 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.49 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.49 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.24 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.42 
 
 
411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  37.3 
 
 
418 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  36.79 
 
 
407 aa  219  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.24 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.73 
 
 
426 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.24 
 
 
411 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.75 
 
 
419 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  37.11 
 
 
405 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  39.01 
 
 
407 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34.63 
 
 
412 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  36.54 
 
 
417 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  31.99 
 
 
411 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  34.58 
 
 
422 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  37.59 
 
 
423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  33.85 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  37.83 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  35.97 
 
 
417 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  38.96 
 
 
404 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  33.09 
 
 
405 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  33.09 
 
 
405 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.94 
 
 
409 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  42.81 
 
 
410 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  35.75 
 
 
413 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  39.58 
 
 
450 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.41 
 
 
392 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  34.7 
 
 
380 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  32.84 
 
 
405 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  34.22 
 
 
402 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  36.84 
 
 
402 aa  205  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  37.11 
 
 
402 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  34.75 
 
 
402 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  36.22 
 
 
418 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  36.36 
 
 
400 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  36.67 
 
 
443 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  32.43 
 
 
401 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  40.35 
 
 
459 aa  202  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  39.13 
 
 
409 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.4 
 
 
388 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  34.09 
 
 
400 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  38.48 
 
 
390 aa  200  5e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  36.94 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  31.23 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  36.08 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  36.73 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  34.72 
 
 
406 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  33.66 
 
 
407 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  35.92 
 
 
414 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  34.66 
 
 
421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  33.17 
 
 
402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  37.08 
 
 
447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  34.1 
 
 
413 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.21 
 
 
408 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  34.48 
 
 
447 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  34.48 
 
 
447 aa  196  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  31.34 
 
 
411 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  38.73 
 
 
442 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  34.35 
 
 
405 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  34.66 
 
 
420 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  34.84 
 
 
398 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  38.81 
 
 
398 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  35.23 
 
 
468 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>