More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1904 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  100 
 
 
443 aa  879    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  76.67 
 
 
436 aa  623  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.16 
 
 
410 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.54 
 
 
402 aa  252  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  39.69 
 
 
401 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  41.12 
 
 
402 aa  249  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  39.46 
 
 
412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.25 
 
 
402 aa  240  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.13 
 
 
398 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  37.53 
 
 
422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.36 
 
 
407 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.38 
 
 
405 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35.54 
 
 
412 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.78 
 
 
399 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.33 
 
 
411 aa  227  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.68 
 
 
412 aa  226  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  36.75 
 
 
429 aa  226  9e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  33.56 
 
 
426 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.72 
 
 
414 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  36.12 
 
 
423 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  36.45 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  38.9 
 
 
407 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.68 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  36.34 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.31 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.71 
 
 
420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  35.63 
 
 
423 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  36.32 
 
 
417 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  36.99 
 
 
411 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  36.74 
 
 
417 aa  217  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  36.5 
 
 
439 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  37.7 
 
 
413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  30.56 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.72 
 
 
388 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.94 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  30.81 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.67 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.67 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  35.99 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2032  cytochrome P450  35.1 
 
 
401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0674155  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  31.64 
 
 
411 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  35.58 
 
 
392 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.45 
 
 
411 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.4 
 
 
411 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  34.15 
 
 
405 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.56 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  31.4 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  31.64 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  36.62 
 
 
416 aa  210  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.99 
 
 
409 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  33.76 
 
 
402 aa  209  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  31.5 
 
 
411 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  35.96 
 
 
398 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  35.77 
 
 
405 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  34.33 
 
 
408 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  36.44 
 
 
404 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  34.79 
 
 
406 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  33.16 
 
 
402 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  34.27 
 
 
421 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34.16 
 
 
412 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.76 
 
 
380 aa  206  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  35.19 
 
 
409 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  34.04 
 
 
413 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.87 
 
 
408 aa  206  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  34.79 
 
 
405 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.34 
 
 
406 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  36.46 
 
 
414 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.28 
 
 
410 aa  205  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  33.42 
 
 
412 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  35.71 
 
 
398 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.59 
 
 
405 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  37.2 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  36.68 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3029  cytochrome P450  35.48 
 
 
433 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.89024  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1598  cytochrome P450  33.89 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  35.49 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.59 
 
 
400 aa  200  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  38.12 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  31.42 
 
 
387 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  35.28 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  37.19 
 
 
407 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  37.19 
 
 
407 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  37.19 
 
 
407 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  33.25 
 
 
402 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  32.84 
 
 
422 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  35.15 
 
 
411 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  33.17 
 
 
398 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1911  cytochrome P450  35.35 
 
 
442 aa  196  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  34.35 
 
 
430 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  34.26 
 
 
399 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  36.36 
 
 
409 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  32.56 
 
 
415 aa  195  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  33.98 
 
 
419 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  34.65 
 
 
459 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  31.94 
 
 
401 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  32.85 
 
 
405 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  32.85 
 
 
405 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  32.63 
 
 
412 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  32.85 
 
 
405 aa  192  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>