More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3600 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  100 
 
 		 402 aa  788    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  41.1 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.15 
 
 		 401 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.81 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.63 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  39.5 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  41.47 
 
 		 426 aa  259  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  36.52 
 
 		 411 aa  258  9e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  42.25 
 
 		 436 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.82 
 
 		 411 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.24 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.48 
 
 		 411 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  39.8 
 
 		 439 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  34.92 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35.73 
 
 		 411 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.36 
 
 		 412 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  35.98 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.23 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  35.43 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.48 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.48 
 
 		 411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.89 
 
 		 410 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.97 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.95 
 
 		 411 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.43 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  41.34 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  38.46 
 
 		 412 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  40.75 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  38.54 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  39.36 
 
 		 417 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  39.79 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.65 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  40.05 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.31 
 
 		 398 aa  230  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  36.68 
 
 		 422 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  41.12 
 
 		 443 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  40.35 
 
 		 423 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  37.93 
 
 		 429 aa  229  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  40.19 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  40.77 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  40.62 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  39.85 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  40.62 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  40.62 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  38.98 
 
 		 407 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  40.15 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.7 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  35.96 
 
 		 413 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  38.67 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  35.94 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.31 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.86 
 
 		 408 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  37.63 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  39.33 
 
 		 419 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  37.62 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.78 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  37.83 
 
 		 417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  36.87 
 
 		 421 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  37.99 
 
 		 407 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  37.99 
 
 		 407 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  33.73 
 
 		 422 aa  212  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  38.32 
 
 		 413 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.67 
 
 		 395 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  37.99 
 
 		 407 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.46 
 
 		 400 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  35.66 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  40.76 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.38 
 
 		 392 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  37.53 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.66 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  37.57 
 
 		 410 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  38.32 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.81 
 
 		 412 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  35.66 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  38.28 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  35.71 
 
 		 420 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2764  cytochrome P450  37.25 
 
 		 799 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.64 
 
 		 406 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  38.17 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  35.42 
 
 		 398 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  39.11 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  41.03 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  33.58 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  33.59 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  37.68 
 
 		 395 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  38.5 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  37.77 
 
 		 410 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.22 
 
 		 401 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  37.17 
 
 		 409 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  32.05 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  37.63 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  37.05 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  36.05 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  37.02 
 
 		 423 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  35.31 
 
 		 398 aa  200  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  37.79 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32630  cytochrome P450  37.06 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.301042  hitchhiker  0.00539785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  36.32 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  34.44 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  35.14 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>