More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3146 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  100 
 
 		 410 aa  811    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  67.33 
 
 		 408 aa  548  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  64.13 
 
 		 408 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  55.33 
 
 		 401 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  54.84 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  58.55 
 
 		 400 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  53.71 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  55.05 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  55.71 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  54.4 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  52.03 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  52.18 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  51.41 
 
 		 400 aa  353  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  49.75 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  48.61 
 
 		 400 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  52.66 
 
 		 357 aa  329  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  46.27 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  46.27 
 
 		 407 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  45.43 
 
 		 421 aa  319  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  47.75 
 
 		 409 aa  319  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  48.74 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  48.28 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  47.69 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  45.82 
 
 		 400 aa  312  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  45.86 
 
 		 408 aa  312  7.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  48.59 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  46.23 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  46.29 
 
 		 407 aa  309  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  47.84 
 
 		 345 aa  299  8e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  44.85 
 
 		 409 aa  296  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  47.42 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  47.42 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  47.42 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  45.52 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  46.52 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  45.07 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  45.64 
 
 		 406 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  43.66 
 
 		 409 aa  289  6e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  44.87 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  43.07 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  46.31 
 
 		 406 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  47.15 
 
 		 400 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  42.44 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  40.6 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  44.42 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  41.54 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  41.88 
 
 		 412 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  41.88 
 
 		 412 aa  269  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  45.14 
 
 		 394 aa  268  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  43.09 
 
 		 407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  41.62 
 
 		 412 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  40 
 
 		 411 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  42.35 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  41.94 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  40.54 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  44.09 
 
 		 404 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  42.54 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  42.54 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  42.54 
 
 		 421 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  41.2 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  47.04 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  43.15 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  42.15 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  40.68 
 
 		 415 aa  252  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  40.5 
 
 		 405 aa  249  9e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  41.08 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  39.41 
 
 		 404 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  42.04 
 
 		 398 aa  246  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  41.37 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  40.45 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  41.86 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  38.25 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  35.9 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  39.19 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  40.48 
 
 		 423 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.78 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.71 
 
 		 411 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  38.5 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  39.43 
 
 		 395 aa  225  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  40 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  39.31 
 
 		 410 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.98 
 
 		 408 aa  222  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  37.8 
 
 		 375 aa  219  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  40.39 
 
 		 423 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  37.19 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  40.66 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  39.75 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.29 
 
 		 410 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  35.41 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  38.69 
 
 		 402 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  37.69 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.91 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  40.9 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.27 
 
 		 406 aa  212  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.08 
 
 		 400 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  38.19 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.88 
 
 		 411 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.93 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  39.89 
 
 		 395 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.58 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>