More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3576 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  100 
 
 		 439 aa  875    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.52 
 
 		 398 aa  255  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.18 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  38.94 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.53 
 
 		 401 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  35.71 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  36.67 
 
 		 422 aa  230  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  38.06 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  38.06 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  38.06 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  37.81 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  36.34 
 
 		 436 aa  220  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.27 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.66 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.66 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.89 
 
 		 408 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  34.4 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.38 
 
 		 412 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  36.41 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.95 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.81 
 
 		 426 aa  207  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  35.5 
 
 		 413 aa  206  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  29.74 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.69 
 
 		 402 aa  206  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  36.5 
 
 		 443 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.16 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.17 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.05 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  29.8 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.64 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  31.57 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  34.15 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.33 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.64 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  34.15 
 
 		 429 aa  203  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.64 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.64 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.16 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  33.67 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.33 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.47 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  35.56 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  35.96 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.72 
 
 		 411 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  33.76 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  34.42 
 
 		 400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  36.03 
 
 		 400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  34.53 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  34.24 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  35.82 
 
 		 417 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  31.49 
 
 		 938 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  34.86 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.33 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  35 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  36.14 
 
 		 427 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  34.92 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  35.01 
 
 		 400 aa  193  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.9 
 
 		 417 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  36.31 
 
 		 409 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  35.84 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  33.57 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  36.5 
 
 		 417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  34.41 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  32.84 
 
 		 407 aa  189  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  32.26 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  34.77 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  34.53 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  34.77 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  33.17 
 
 		 459 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  31.81 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  36.29 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  33.25 
 
 		 399 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  32.92 
 
 		 412 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  31.74 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  35.73 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  33.33 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  29.97 
 
 		 398 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  27.85 
 
 		 403 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  36.16 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  33.97 
 
 		 400 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  31.81 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  35.22 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  35.69 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  31.99 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  30.47 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  33.81 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0542  cytochrome P450  33.42 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.353046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0556  cytochrome P450 enzyme  33.42 
 
 		 407 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  34.13 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  30.48 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  33.08 
 
 		 408 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3772  cytochrome P450  30.88 
 
 		 418 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  35.83 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  33.08 
 
 		 406 aa  179  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  31.9 
 
 		 401 aa  179  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  35.36 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  33.33 
 
 		 400 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  34.13 
 
 		 408 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>