More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4206 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  100 
 
 
406 aa  795    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  52.37 
 
 
400 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  51.13 
 
 
412 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  44.36 
 
 
405 aa  328  9e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  44.25 
 
 
400 aa  312  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  46.17 
 
 
411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  45.69 
 
 
400 aa  300  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  42.79 
 
 
412 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  45.09 
 
 
408 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  37.31 
 
 
420 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  43.7 
 
 
410 aa  289  7e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  41.28 
 
 
396 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  43.73 
 
 
402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  44.19 
 
 
426 aa  285  9e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  41.84 
 
 
411 aa  282  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  43.37 
 
 
398 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  36.73 
 
 
411 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  42.28 
 
 
402 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  44.57 
 
 
418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  43.26 
 
 
414 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.83 
 
 
411 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  35.97 
 
 
411 aa  265  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  36.15 
 
 
411 aa  265  8e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  40.75 
 
 
419 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  36.78 
 
 
411 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  36.52 
 
 
411 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  37.03 
 
 
411 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  37.03 
 
 
411 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  43.54 
 
 
405 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  36.78 
 
 
411 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.52 
 
 
411 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  43.64 
 
 
394 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.52 
 
 
411 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.05 
 
 
401 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  38.68 
 
 
408 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  42.53 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.59 
 
 
417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  42.13 
 
 
407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  41.79 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  43.43 
 
 
407 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  43.43 
 
 
407 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  42.5 
 
 
420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  42.78 
 
 
406 aa  252  7e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  38.05 
 
 
401 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  41.3 
 
 
399 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  43.3 
 
 
403 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  41.19 
 
 
400 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  40.21 
 
 
388 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  40.81 
 
 
407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  40.81 
 
 
407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  41.49 
 
 
395 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  40.93 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  36.72 
 
 
380 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  40.61 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  40.61 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  40.61 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  42.01 
 
 
401 aa  242  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  40.25 
 
 
393 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  39.5 
 
 
409 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  40.71 
 
 
399 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  41.73 
 
 
395 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  39.7 
 
 
459 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.66 
 
 
407 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  41.09 
 
 
430 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  40.93 
 
 
409 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  41.27 
 
 
391 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  37.56 
 
 
405 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  39.37 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  40.87 
 
 
407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  36.62 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  40.21 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  39.09 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  40.57 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  40.05 
 
 
413 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  41.4 
 
 
399 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  39.39 
 
 
421 aa  234  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  37.3 
 
 
398 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  37.85 
 
 
408 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  39.43 
 
 
403 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  37.2 
 
 
402 aa  231  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  39.34 
 
 
398 aa  230  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  40 
 
 
392 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  37.47 
 
 
402 aa  229  7e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  40.36 
 
 
401 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.69 
 
 
407 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  38.02 
 
 
419 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  38.38 
 
 
406 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  40.67 
 
 
375 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  38.08 
 
 
436 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.65 
 
 
410 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  40.46 
 
 
402 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  39.36 
 
 
429 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  39.68 
 
 
382 aa  227  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  39.9 
 
 
436 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  41.16 
 
 
409 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  38.73 
 
 
409 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  39.53 
 
 
422 aa  226  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  39.85 
 
 
402 aa  225  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  40.31 
 
 
406 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  39.84 
 
 
423 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>