More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1189 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  86.65 
 
 
408 aa  690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  100 
 
 
404 aa  805    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  70 
 
 
417 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  68.25 
 
 
406 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  69.75 
 
 
417 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  68.17 
 
 
407 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  65.33 
 
 
405 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  67.1 
 
 
409 aa  518  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  64.6 
 
 
406 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  49.87 
 
 
402 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  40.25 
 
 
411 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.66 
 
 
401 aa  256  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.44 
 
 
402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  40.56 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  35.88 
 
 
420 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  39.9 
 
 
429 aa  249  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  40.72 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  37.19 
 
 
414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.68 
 
 
398 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37.09 
 
 
407 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  37.62 
 
 
423 aa  239  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.13 
 
 
426 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.82 
 
 
392 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.4 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  36.34 
 
 
408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  35.54 
 
 
400 aa  230  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  37.53 
 
 
402 aa  229  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  36.22 
 
 
412 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  37.13 
 
 
404 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  39.65 
 
 
410 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  36.95 
 
 
407 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  36.13 
 
 
409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  36.69 
 
 
407 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  36.69 
 
 
407 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.34 
 
 
405 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  35.7 
 
 
412 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.63 
 
 
412 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.65 
 
 
411 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.89 
 
 
405 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.17 
 
 
411 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.5 
 
 
411 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.5 
 
 
411 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.51 
 
 
411 aa  222  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.76 
 
 
411 aa  222  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.17 
 
 
411 aa  222  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.98 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.25 
 
 
411 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.22 
 
 
411 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  37.37 
 
 
418 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.7 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  35.23 
 
 
398 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  38.24 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.24 
 
 
407 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  39.64 
 
 
421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  36.71 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  37.31 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  31.84 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  34.33 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  39.03 
 
 
390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.13 
 
 
412 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  37.4 
 
 
417 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  34.11 
 
 
415 aa  212  9e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.17 
 
 
410 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  35 
 
 
412 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  35.53 
 
 
436 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  35.39 
 
 
380 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  36.39 
 
 
396 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  35.8 
 
 
429 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  38.6 
 
 
414 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  33.33 
 
 
399 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  36.27 
 
 
406 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  38.96 
 
 
417 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.04 
 
 
408 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  34.73 
 
 
422 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  36.61 
 
 
405 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  38.07 
 
 
416 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  35.43 
 
 
387 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  39.85 
 
 
414 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  34.77 
 
 
395 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.91 
 
 
400 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  35.09 
 
 
405 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  35.09 
 
 
405 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  33.72 
 
 
419 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  35.09 
 
 
405 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  37.24 
 
 
423 aa  206  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  34.03 
 
 
430 aa  206  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  35.23 
 
 
398 aa  205  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  32.86 
 
 
414 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  34.94 
 
 
396 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  33.59 
 
 
405 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.03 
 
 
411 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  35.04 
 
 
418 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  35.04 
 
 
406 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  35.04 
 
 
406 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  36.57 
 
 
394 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  36.9 
 
 
417 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  36.57 
 
 
409 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  36.92 
 
 
404 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  36.8 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33 
 
 
400 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>