More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4029 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  100 
 
 
422 aa  846    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  75.06 
 
 
413 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  65.41 
 
 
429 aa  546  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.29 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.3 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  40.05 
 
 
398 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.52 
 
 
405 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.71 
 
 
407 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.81 
 
 
420 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  38.55 
 
 
402 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.31 
 
 
410 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  37.19 
 
 
400 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.05 
 
 
412 aa  236  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.06 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  39.15 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  36.32 
 
 
436 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  39.01 
 
 
409 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  36.78 
 
 
407 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  38.05 
 
 
423 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  36.78 
 
 
407 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  36.78 
 
 
407 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  36.67 
 
 
439 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  36.68 
 
 
402 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  38.18 
 
 
405 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  35.18 
 
 
405 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.89 
 
 
411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.76 
 
 
412 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.39 
 
 
388 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.05 
 
 
405 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  36.76 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  35.03 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.13 
 
 
411 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  31.62 
 
 
411 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  31.62 
 
 
411 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  36.3 
 
 
406 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  35.71 
 
 
417 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  31.13 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  36.25 
 
 
398 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  35.96 
 
 
406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  31.09 
 
 
411 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.18 
 
 
410 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  31.13 
 
 
411 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  36.8 
 
 
417 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  30.63 
 
 
408 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.13 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.13 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  30.5 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.88 
 
 
411 aa  215  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  30.88 
 
 
411 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  30.88 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  37.53 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  37.88 
 
 
404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.04 
 
 
408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  36.86 
 
 
407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  36.23 
 
 
414 aa  213  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.32 
 
 
408 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  34.76 
 
 
399 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.48 
 
 
411 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  30.73 
 
 
411 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  37.01 
 
 
405 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.28 
 
 
411 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  35.93 
 
 
409 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  36.5 
 
 
398 aa  209  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  34.98 
 
 
417 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.44 
 
 
410 aa  209  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.83 
 
 
412 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  34.73 
 
 
404 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.93 
 
 
419 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  34.43 
 
 
423 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  37.14 
 
 
423 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  34.74 
 
 
400 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.39 
 
 
426 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  33.42 
 
 
421 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  36.82 
 
 
410 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2032  cytochrome P450  35.93 
 
 
401 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0674155  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  33 
 
 
400 aa  203  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  31.94 
 
 
412 aa  203  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.35 
 
 
405 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.08 
 
 
400 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  31.94 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  36.45 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  32.83 
 
 
398 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.45 
 
 
401 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  33 
 
 
399 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  33.08 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  33.5 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  30.39 
 
 
938 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  33.01 
 
 
414 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  31.58 
 
 
402 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  33.17 
 
 
387 aa  199  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  32.19 
 
 
415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  30.73 
 
 
380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  31.08 
 
 
402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  34 
 
 
408 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  34.16 
 
 
387 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  36.32 
 
 
399 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  36.08 
 
 
450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  30.86 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  37.41 
 
 
416 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  32.07 
 
 
418 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>