More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0173 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  100 
 
 
395 aa  790    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  63.41 
 
 
399 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  58 
 
 
400 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  60.53 
 
 
401 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  57.37 
 
 
400 aa  418  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  53.96 
 
 
401 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  55.58 
 
 
408 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  55.91 
 
 
399 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  53.1 
 
 
436 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  54.4 
 
 
410 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  52.99 
 
 
402 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  49.75 
 
 
407 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  53.68 
 
 
400 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  52.07 
 
 
408 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  51.15 
 
 
430 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  50.92 
 
 
400 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  49.87 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  56.47 
 
 
357 aa  348  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  49.38 
 
 
400 aa  345  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  48.3 
 
 
408 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  50.74 
 
 
409 aa  338  7e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  51.02 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  50.38 
 
 
406 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  50.38 
 
 
406 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  48.42 
 
 
400 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  50.38 
 
 
406 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  49.09 
 
 
414 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  47.04 
 
 
405 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  47.97 
 
 
409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  47.07 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  47.75 
 
 
407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  47.68 
 
 
399 aa  321  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  48.73 
 
 
406 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  47.22 
 
 
401 aa  318  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  50.76 
 
 
394 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  46.13 
 
 
397 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  43.62 
 
 
407 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  43.62 
 
 
407 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  48.61 
 
 
406 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  45.06 
 
 
408 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  46.56 
 
 
398 aa  309  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  43.55 
 
 
409 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3276  cytochrome P450  46.72 
 
 
407 aa  305  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.684608  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  46.13 
 
 
416 aa  301  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  44.79 
 
 
405 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  48.55 
 
 
345 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  42.34 
 
 
409 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  45.29 
 
 
404 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  43.72 
 
 
412 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4201  cytochrome P450  43.97 
 
 
421 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  43.72 
 
 
412 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4267  cytochrome P450  43.97 
 
 
421 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.476691  normal  0.954738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4428  cytochrome P450  43.97 
 
 
421 aa  292  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392257  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  44.53 
 
 
388 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  43.46 
 
 
412 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  43.61 
 
 
406 aa  288  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  42.61 
 
 
415 aa  285  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  41.98 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2535  cytochrome P450  45.38 
 
 
423 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  40.66 
 
 
415 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  41.46 
 
 
410 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4429  cytochrome P450  42.75 
 
 
413 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  41.67 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  44.15 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  44.62 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  41.37 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  45.55 
 
 
397 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  41.06 
 
 
405 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  41.01 
 
 
405 aa  270  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3470  cytochrome P450  44.7 
 
 
404 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0620803  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  44.09 
 
 
400 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  40.25 
 
 
424 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  43.05 
 
 
398 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.21 
 
 
412 aa  264  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  42.27 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  41.42 
 
 
375 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  40.41 
 
 
408 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3162  cytochrome P450  41.34 
 
 
404 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.411247  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3692  cytochrome P450  40.05 
 
 
397 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  40.72 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2524  cytochrome P450  42.49 
 
 
405 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  42.2 
 
 
395 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  37.29 
 
 
407 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  39.29 
 
 
402 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  38.56 
 
 
393 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  39.12 
 
 
400 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.96 
 
 
402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.44 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  39.4 
 
 
411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  40.05 
 
 
398 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.59 
 
 
400 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  36.61 
 
 
404 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.38 
 
 
411 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.86 
 
 
398 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  37.69 
 
 
399 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  36.52 
 
 
403 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  41.73 
 
 
406 aa  229  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  37.65 
 
 
395 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  39.38 
 
 
400 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  38.11 
 
 
410 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>