More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0041 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  100 
 
 		 407 aa  833    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  42.22 
 
 		 405 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  42.07 
 
 		 402 aa  295  8e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.5 
 
 		 401 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.54 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  41.23 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.01 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  36.7 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.5 
 
 		 405 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  39.7 
 
 		 392 aa  260  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  38.52 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.94 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  40.49 
 
 		 411 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.18 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  39.17 
 
 		 414 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  35.18 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  38.65 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.9 
 
 		 388 aa  254  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.07 
 
 		 417 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  35.71 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  38.83 
 
 		 405 aa  253  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  40.15 
 
 		 398 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  36.36 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  37.34 
 
 		 380 aa  250  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  37.91 
 
 		 410 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.79 
 
 		 420 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.23 
 
 		 426 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.49 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.38 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  35.48 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  37.59 
 
 		 405 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  36.96 
 
 		 408 aa  245  9e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  38.2 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  38.86 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  38.05 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  38.08 
 
 		 406 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  37 
 
 		 408 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  36.39 
 
 		 409 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  37.09 
 
 		 404 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  37.03 
 
 		 398 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  36.43 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  35.59 
 
 		 414 aa  239  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  36.34 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  36.52 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  36.27 
 
 		 436 aa  236  4e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.47 
 
 		 410 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  37.31 
 
 		 407 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  37.66 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  36.27 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  37.31 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  36.32 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  37.31 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  37.53 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  36.98 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  37.44 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  37.38 
 
 		 400 aa  233  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  35.27 
 
 		 410 aa  233  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  35.21 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  36.84 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34.98 
 
 		 412 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  37.1 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  34.98 
 
 		 412 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  35.17 
 
 		 419 aa  229  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  34.16 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  35.25 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  33.67 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  32.6 
 
 		 413 aa  226  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  36.71 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  34.48 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  33.92 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  32.92 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  32.59 
 
 		 938 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2452  cytochrome P450 family protein  36.57 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2650  cytochrome P450 family protein  36.57 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000122634 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2632  cytochrome P450 family protein  36.57 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2414  cytochrome P450  36.57 
 
 		 404 aa  221  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000201211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  32.43 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  36.41 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  34.69 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2656  cytochrome P450 family protein  35.66 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  37.35 
 
 		 450 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  37.18 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  36.41 
 
 		 399 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  36.36 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  38.2 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  33.9 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  34.3 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  35.9 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  35.56 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  36 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.25 
 
 		 408 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  35.75 
 
 		 399 aa  216  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  35.07 
 
 		 421 aa  216  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3665  cytochrome P450  31.76 
 
 		 411 aa  216  8e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  33.66 
 
 		 402 aa  215  9e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  37.06 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  33 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  39.38 
 
 		 447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  33.74 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  36.72 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>