More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0290 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  100 
 
 
405 aa  833    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  42.22 
 
 
407 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.35 
 
 
412 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  35.71 
 
 
402 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  34.84 
 
 
398 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36.45 
 
 
392 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.1 
 
 
401 aa  229  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  35.18 
 
 
422 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  33.83 
 
 
405 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.84 
 
 
426 aa  219  7.999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  35.98 
 
 
407 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  35.98 
 
 
407 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  35.98 
 
 
407 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  36.69 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  31.74 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  34.11 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  36.83 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.22 
 
 
411 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.22 
 
 
411 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  31.22 
 
 
411 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  35.53 
 
 
405 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  34.16 
 
 
405 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  33.84 
 
 
429 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  30.62 
 
 
411 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  33.58 
 
 
398 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.6 
 
 
400 aa  209  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  30.46 
 
 
411 aa  209  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.12 
 
 
411 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.96 
 
 
411 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  34.15 
 
 
414 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  32.49 
 
 
413 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  30.46 
 
 
411 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  31.9 
 
 
411 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  29.95 
 
 
411 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  32.01 
 
 
410 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  31.57 
 
 
439 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  34.76 
 
 
402 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  34.13 
 
 
409 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1769  cytochrome P450  30.62 
 
 
395 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.266129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  29.95 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  32.47 
 
 
399 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.23 
 
 
411 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  33.66 
 
 
412 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  34.27 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.6 
 
 
406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  31.2 
 
 
380 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  31.43 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  33.91 
 
 
406 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.09 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.42 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  39.56 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  31.99 
 
 
417 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  34.56 
 
 
409 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  33.08 
 
 
398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  32.25 
 
 
390 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  32.74 
 
 
419 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  32.26 
 
 
399 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  32.18 
 
 
436 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  33.59 
 
 
400 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  28.92 
 
 
420 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  31.76 
 
 
408 aa  193  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  33.17 
 
 
408 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  32.75 
 
 
417 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  33.09 
 
 
414 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  32.58 
 
 
404 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  33.92 
 
 
395 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  32.88 
 
 
417 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  32.83 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  31.12 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  31.54 
 
 
405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  33.25 
 
 
419 aa  189  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  32.31 
 
 
423 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  33.75 
 
 
404 aa  189  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  29.41 
 
 
938 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  34 
 
 
400 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3250  P450 heme-thiolate protein, putative  29.87 
 
 
411 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.09 
 
 
417 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  34.26 
 
 
419 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  33.33 
 
 
400 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  38.38 
 
 
404 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  34.43 
 
 
395 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  32.58 
 
 
406 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  32.32 
 
 
459 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  31.51 
 
 
429 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  31.78 
 
 
410 aa  186  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  31.62 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0737  cytochrome P450  29.11 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  29.6 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2799  cytochrome P450  35.87 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  30.88 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  29.11 
 
 
411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  33.87 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  34.86 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  29.01 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  33.09 
 
 
420 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  31.37 
 
 
411 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  32.75 
 
 
407 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  32.99 
 
 
398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  31.08 
 
 
405 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  32.22 
 
 
410 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>