More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0342 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  82.65 
 
 		 393 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  82.91 
 
 		 393 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  100 
 
 		 407 aa  808    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  57.8 
 
 		 387 aa  435  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  53.32 
 
 		 415 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  54.1 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  47.52 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  47.03 
 
 		 415 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  47.28 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  45.54 
 
 		 414 aa  312  9e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  41.06 
 
 		 402 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.82 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  39.95 
 
 		 410 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  39.49 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  39.2 
 
 		 405 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  41.84 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  37.06 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  39.13 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  36.86 
 
 		 408 aa  233  3e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  38.87 
 
 		 407 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  38.87 
 
 		 407 aa  233  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  38.78 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.08 
 
 		 420 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  37.22 
 
 		 410 aa  222  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  39.45 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3536  cytochrome P450  37.69 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00204069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  36.39 
 
 		 409 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  35.92 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  40.2 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  36.18 
 
 		 417 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  43 
 
 		 402 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.38 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.16 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  36.32 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.79 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.4 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  35.06 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.44 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  33.17 
 
 		 411 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  35.94 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  34.45 
 
 		 399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  33.42 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  33.42 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  33.42 
 
 		 411 aa  199  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  35.79 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  33.16 
 
 		 411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.91 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.91 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  35.52 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  34.24 
 
 		 436 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  34.19 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  35.75 
 
 		 413 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  35.54 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  35.42 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.4 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  34.17 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  35.79 
 
 		 398 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.56 
 
 		 426 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  34.03 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  32.59 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  34.81 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  34.37 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  36.78 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  36.34 
 
 		 408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.44 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  32.92 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  37.98 
 
 		 406 aa  190  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  33.33 
 
 		 398 aa  189  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  32.85 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4741  cytochrome P450  37.6 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  32.6 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  36.95 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  32.86 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  32.86 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  35.19 
 
 		 423 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  32.86 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  35.84 
 
 		 411 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.77 
 
 		 400 aa  186  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  32.54 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.52 
 
 		 388 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  35.54 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  33.68 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  33.84 
 
 		 464 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  36.06 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  37.42 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  37.44 
 
 		 411 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  36.5 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  33.98 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  33.42 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.06 
 
 		 400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.85 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  32.05 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  32.48 
 
 		 402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  33.76 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  30.32 
 
 		 422 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  32.4 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  36.11 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  34.57 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  35.81 
 
 		 404 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  36.33 
 
 		 411 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>