More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2495 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  100 
 
 
464 aa  912    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  48.05 
 
 
447 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  48.05 
 
 
447 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  48.41 
 
 
447 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  47.66 
 
 
443 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  46.73 
 
 
444 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  46.03 
 
 
438 aa  366  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  49.66 
 
 
450 aa  362  6e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  45.35 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  44.55 
 
 
431 aa  318  9e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  40.14 
 
 
417 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  37.99 
 
 
409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  40.24 
 
 
410 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  40.73 
 
 
405 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  38.92 
 
 
402 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  41.59 
 
 
412 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  38.78 
 
 
430 aa  226  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  40.58 
 
 
407 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  40 
 
 
402 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  38.01 
 
 
409 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.39 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  40.34 
 
 
407 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  40.34 
 
 
407 aa  223  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  40.85 
 
 
416 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.56 
 
 
410 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  41.11 
 
 
404 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  38.15 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  38.15 
 
 
411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.37 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  42.57 
 
 
401 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  39.7 
 
 
410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  37.85 
 
 
411 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  36.88 
 
 
398 aa  216  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  37.85 
 
 
411 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  37.85 
 
 
411 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  37.54 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  37.54 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  38.2 
 
 
429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  37.23 
 
 
411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  37 
 
 
411 aa  213  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  37.77 
 
 
419 aa  212  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37 
 
 
411 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  36.05 
 
 
398 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  41.41 
 
 
417 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6383  cytochrome P450-like protein  56.11 
 
 
379 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  37.15 
 
 
412 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.77 
 
 
411 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  40.24 
 
 
395 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  38.93 
 
 
423 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  40.99 
 
 
394 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  36.32 
 
 
411 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  38.57 
 
 
421 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  34.72 
 
 
402 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  36.8 
 
 
412 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  38.52 
 
 
423 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  37.56 
 
 
421 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  42.51 
 
 
400 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.84 
 
 
388 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  38.39 
 
 
419 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36.89 
 
 
398 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  37.38 
 
 
406 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  38.86 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  39.2 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.73 
 
 
405 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  38.86 
 
 
408 aa  199  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  35.25 
 
 
417 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  38.89 
 
 
423 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  40.62 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  36.08 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  36.83 
 
 
414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.31 
 
 
411 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  35.7 
 
 
417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.44 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.55 
 
 
426 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.78 
 
 
407 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  33.01 
 
 
410 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  40.24 
 
 
411 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  33.01 
 
 
408 aa  195  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  35.82 
 
 
395 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  35.67 
 
 
390 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.68 
 
 
400 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  38.15 
 
 
411 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  36.6 
 
 
392 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  34.84 
 
 
401 aa  193  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  37.56 
 
 
413 aa  193  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  37.57 
 
 
418 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  41.42 
 
 
398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  37.5 
 
 
387 aa  190  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  32.15 
 
 
422 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  35.42 
 
 
390 aa  190  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  33.17 
 
 
399 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  35.95 
 
 
408 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  32.84 
 
 
399 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.24 
 
 
408 aa  189  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.44 
 
 
412 aa  189  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  33.66 
 
 
404 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  33.66 
 
 
404 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  38.81 
 
 
414 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  40.48 
 
 
402 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  33.66 
 
 
404 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>