More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0142 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  100 
 
 
426 aa  845    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  46 
 
 
411 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  45.02 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  41.13 
 
 
405 aa  312  6.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  44.26 
 
 
412 aa  306  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  43.81 
 
 
418 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  41.02 
 
 
412 aa  299  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  41.29 
 
 
398 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  41.4 
 
 
417 aa  289  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  42.52 
 
 
420 aa  285  9e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  36.08 
 
 
420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  40.2 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  42.25 
 
 
402 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  37.78 
 
 
411 aa  279  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  39.57 
 
 
419 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37.04 
 
 
411 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  37.87 
 
 
411 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  44.68 
 
 
406 aa  272  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.21 
 
 
401 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  36.54 
 
 
411 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.48 
 
 
411 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.48 
 
 
411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  40.69 
 
 
410 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  39.52 
 
 
423 aa  269  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  37.62 
 
 
411 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  41.06 
 
 
414 aa  269  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  37.38 
 
 
411 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  37.38 
 
 
411 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.19 
 
 
411 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  43.43 
 
 
398 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  37.13 
 
 
411 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  40.83 
 
 
399 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  42.89 
 
 
400 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  40.46 
 
 
400 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.41 
 
 
410 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  41.47 
 
 
402 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  38.36 
 
 
396 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.23 
 
 
407 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  39.27 
 
 
412 aa  249  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  40.43 
 
 
400 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  39.9 
 
 
418 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.16 
 
 
402 aa  246  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  38.56 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  37.1 
 
 
405 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  39.23 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  37.35 
 
 
409 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.68 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  41.12 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  38.58 
 
 
417 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  37.47 
 
 
417 aa  242  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  40.55 
 
 
394 aa  242  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  39.61 
 
 
414 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  38.93 
 
 
409 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  37.86 
 
 
395 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  38.83 
 
 
404 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  37.13 
 
 
404 aa  237  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  38.76 
 
 
417 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  40.87 
 
 
398 aa  235  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  39.84 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  40.71 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  38.14 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  37.08 
 
 
407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  36.08 
 
 
410 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.29 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  37.08 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  37.08 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  38.37 
 
 
422 aa  233  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  41.16 
 
 
430 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  37.74 
 
 
407 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  37.4 
 
 
423 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  38.35 
 
 
409 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  35.59 
 
 
406 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  38.6 
 
 
408 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  39.43 
 
 
403 aa  229  6e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  36.23 
 
 
436 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  39.41 
 
 
421 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  40.11 
 
 
399 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.87 
 
 
429 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  38.13 
 
 
413 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  36.15 
 
 
380 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  35.48 
 
 
402 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.92 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  34.54 
 
 
402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  36.82 
 
 
408 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  38.83 
 
 
406 aa  226  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.73 
 
 
405 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.8 
 
 
405 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  40.05 
 
 
406 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  40.79 
 
 
373 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  40.16 
 
 
450 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  39.84 
 
 
407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4427  cytochrome P450  37.44 
 
 
382 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  39.84 
 
 
407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  37.23 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  37.12 
 
 
401 aa  223  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.4 
 
 
419 aa  223  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  38.27 
 
 
411 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  31.74 
 
 
399 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  41.29 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34.99 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>