More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2385 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  100 
 
 		 412 aa  806    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  48.49 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  48.72 
 
 		 408 aa  342  5.999999999999999e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  49.25 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  51.13 
 
 		 406 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  47.98 
 
 		 400 aa  329  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  47.83 
 
 		 402 aa  326  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  42.14 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  46.85 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  44.39 
 
 		 411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  47.19 
 
 		 400 aa  312  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  44.26 
 
 		 426 aa  306  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  45.54 
 
 		 418 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  46.55 
 
 		 414 aa  300  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  44.19 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  44.07 
 
 		 423 aa  295  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  43.32 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  40.15 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  40 
 
 		 411 aa  285  9e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  45.31 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  39.9 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  39.75 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  43.89 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  43.56 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  42.54 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  44.13 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  39.49 
 
 		 411 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  42.39 
 
 		 419 aa  280  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  46.29 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  39.24 
 
 		 411 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  39.24 
 
 		 411 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  39.39 
 
 		 411 aa  279  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  39.24 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  39.24 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  43.93 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  40.35 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  41.23 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  41.5 
 
 		 398 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  40.22 
 
 		 411 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  41.9 
 
 		 410 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  40.95 
 
 		 412 aa  269  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  43.87 
 
 		 398 aa  269  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  42.89 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  43.04 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  42.21 
 
 		 395 aa  264  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  40.78 
 
 		 395 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  43.17 
 
 		 421 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  41.9 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  45.12 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  41.87 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  42.05 
 
 		 422 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  42.49 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  38.79 
 
 		 420 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  41.75 
 
 		 409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  42.82 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  39.35 
 
 		 421 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  41.71 
 
 		 406 aa  256  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  43.24 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  42.78 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  43.24 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  42.78 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  43.15 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  43.24 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  43.33 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  41.69 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  41.56 
 
 		 429 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  42.61 
 
 		 421 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  41.83 
 
 		 402 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  41.55 
 
 		 423 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  40.51 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  42.3 
 
 		 424 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  40.67 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  42.36 
 
 		 402 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  40.56 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  40.54 
 
 		 413 aa  247  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  38.08 
 
 		 403 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  43.18 
 
 		 394 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  39.33 
 
 		 408 aa  245  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  45.78 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  41.44 
 
 		 407 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  42.39 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.82 
 
 		 388 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  40.7 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  41.33 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37.72 
 
 		 407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  39.43 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  40.21 
 
 		 393 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  41.02 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  40.87 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  40.39 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  40.55 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  40.68 
 
 		 412 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  41.45 
 
 		 400 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  37.78 
 
 		 402 aa  239  9e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  41.34 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  40.93 
 
 		 407 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  40.38 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  37.72 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  40.26 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  44.15 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>