More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2064 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  100 
 
 
408 aa  838    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  81.93 
 
 
410 aa  675    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  56.69 
 
 
396 aa  424  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  50.13 
 
 
399 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  51.26 
 
 
412 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  45.1 
 
 
402 aa  320  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  40.83 
 
 
415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  42.36 
 
 
405 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  42.24 
 
 
405 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  37.8 
 
 
420 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  40.1 
 
 
414 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.79 
 
 
401 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  41.91 
 
 
410 aa  278  9e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39.66 
 
 
398 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  39.58 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  36.92 
 
 
411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  36.67 
 
 
411 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  36.92 
 
 
411 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  36.67 
 
 
411 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  36.67 
 
 
411 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.41 
 
 
402 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.92 
 
 
411 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.92 
 
 
411 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  36.67 
 
 
411 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  40.52 
 
 
414 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.35 
 
 
411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.7 
 
 
411 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  40.75 
 
 
410 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  37.09 
 
 
411 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  35.7 
 
 
411 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  40.25 
 
 
419 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  39.9 
 
 
387 aa  260  3e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  44.27 
 
 
429 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  39.95 
 
 
410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.14 
 
 
412 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  36.79 
 
 
415 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  39.46 
 
 
423 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3536  cytochrome P450  38.44 
 
 
391 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00204069  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.96 
 
 
407 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.85 
 
 
408 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  36.64 
 
 
393 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  38.83 
 
 
411 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  36.64 
 
 
393 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.47 
 
 
411 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  37.78 
 
 
390 aa  236  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  35.94 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  36.34 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  37.96 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  35.81 
 
 
408 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  35.71 
 
 
417 aa  233  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  35.66 
 
 
417 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.58 
 
 
411 aa  229  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  37.19 
 
 
414 aa  229  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  36.86 
 
 
407 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  34.33 
 
 
398 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  37.19 
 
 
416 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.59 
 
 
400 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  34.85 
 
 
417 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.92 
 
 
426 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.57 
 
 
409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  35.58 
 
 
412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.59 
 
 
412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  40.16 
 
 
417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  37.32 
 
 
414 aa  226  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  35.58 
 
 
412 aa  226  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  35.18 
 
 
392 aa  226  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  35.56 
 
 
398 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.73 
 
 
406 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.24 
 
 
405 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  37.41 
 
 
394 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  40.06 
 
 
409 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  34.46 
 
 
407 aa  222  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  34.83 
 
 
405 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  38.17 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  35.24 
 
 
398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  36.36 
 
 
417 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.25 
 
 
388 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  37.62 
 
 
398 aa  219  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  35.86 
 
 
402 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  35.29 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  34.74 
 
 
406 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  33.82 
 
 
402 aa  217  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  34.72 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  33.59 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.4 
 
 
400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  34.98 
 
 
407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  35.04 
 
 
422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.98 
 
 
407 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  34.98 
 
 
407 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  32.26 
 
 
403 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  36 
 
 
413 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  36.77 
 
 
417 aa  211  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  34.12 
 
 
402 aa  209  9e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.99 
 
 
405 aa  208  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  34.78 
 
 
417 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  32.75 
 
 
380 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8869  cytochrome P450 CYP124E1  35.41 
 
 
400 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180285  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  39.34 
 
 
402 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  33.33 
 
 
402 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  34.3 
 
 
429 aa  206  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>