More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2844 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  100 
 
 
409 aa  823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  77.44 
 
 
406 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  76.13 
 
 
405 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  74.31 
 
 
406 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  68.55 
 
 
417 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  68.49 
 
 
417 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  69 
 
 
407 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  66.83 
 
 
404 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  65.17 
 
 
408 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  50.5 
 
 
402 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.87 
 
 
401 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.4 
 
 
420 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.06 
 
 
402 aa  255  9e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  38.37 
 
 
414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  40.21 
 
 
392 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.23 
 
 
410 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.59 
 
 
426 aa  245  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.44 
 
 
398 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  37.91 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  39.24 
 
 
411 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.1 
 
 
407 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  37.65 
 
 
410 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  38.33 
 
 
429 aa  241  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.37 
 
 
405 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  37.16 
 
 
400 aa  240  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  33.67 
 
 
411 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.42 
 
 
411 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  34.75 
 
 
411 aa  235  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.01 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  34.75 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.01 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  34.22 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.41 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  34.75 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  37.97 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  34.48 
 
 
411 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  39.01 
 
 
422 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  34.22 
 
 
411 aa  232  9e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.12 
 
 
410 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.12 
 
 
388 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  35.38 
 
 
409 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  36.97 
 
 
405 aa  229  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  37.25 
 
 
418 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.57 
 
 
408 aa  226  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  36.09 
 
 
407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.41 
 
 
411 aa  226  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.41 
 
 
412 aa  226  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  35.84 
 
 
407 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  35.84 
 
 
407 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  37.18 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  36.1 
 
 
398 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  36.6 
 
 
436 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.16 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  38.96 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.06 
 
 
400 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  35.48 
 
 
380 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.13 
 
 
412 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  35.91 
 
 
450 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  36.98 
 
 
407 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.73 
 
 
408 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  35.66 
 
 
423 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  40.13 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  35.04 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  36.36 
 
 
398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  35.14 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  39.29 
 
 
421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  35.14 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  35.14 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  33.87 
 
 
399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  32.35 
 
 
410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  38.94 
 
 
423 aa  213  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  36.29 
 
 
419 aa  213  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  33.74 
 
 
401 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  38 
 
 
390 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  35.55 
 
 
417 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  34.91 
 
 
405 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  36.22 
 
 
406 aa  209  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.75 
 
 
411 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.86 
 
 
400 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  33.33 
 
 
442 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  36.15 
 
 
417 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1321  cytochrome P450  38.11 
 
 
404 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.662469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  34.46 
 
 
405 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  36.1 
 
 
414 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  34.46 
 
 
405 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  33.17 
 
 
412 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  34.22 
 
 
405 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  32.75 
 
 
412 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  32.66 
 
 
412 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  32.24 
 
 
411 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  32.92 
 
 
419 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  33.25 
 
 
405 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  35.68 
 
 
404 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  35.68 
 
 
404 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  34.74 
 
 
417 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  34.13 
 
 
405 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  35.68 
 
 
404 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  34.83 
 
 
396 aa  202  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5481  cytochrome P450  36.99 
 
 
409 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170378  normal  0.213356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  37.07 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>