More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3652 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  100 
 
 
406 aa  824    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  85.71 
 
 
405 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  83 
 
 
406 aa  690    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  77.55 
 
 
409 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  65.76 
 
 
407 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  63.91 
 
 
417 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  63.41 
 
 
417 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  64.6 
 
 
404 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  63.5 
 
 
408 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  46.87 
 
 
402 aa  342  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.37 
 
 
401 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  39.05 
 
 
402 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  35.71 
 
 
420 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.84 
 
 
398 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  35.84 
 
 
399 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.34 
 
 
407 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.34 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  37.22 
 
 
410 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  36.11 
 
 
410 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.59 
 
 
426 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  35.82 
 
 
414 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  34.6 
 
 
409 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.94 
 
 
405 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.85 
 
 
388 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.33 
 
 
436 aa  226  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  36.36 
 
 
411 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  35.62 
 
 
402 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  35.11 
 
 
423 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  39.95 
 
 
421 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  36.76 
 
 
404 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.94 
 
 
410 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.34 
 
 
392 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  34.41 
 
 
400 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.07 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  34.52 
 
 
407 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  34.55 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  35.96 
 
 
422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  34.74 
 
 
408 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.81 
 
 
411 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.26 
 
 
407 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  34.26 
 
 
407 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  37.87 
 
 
423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  34.78 
 
 
405 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  38.07 
 
 
418 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  33.76 
 
 
412 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.25 
 
 
411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.25 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  39.07 
 
 
423 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  35.11 
 
 
405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.98 
 
 
411 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.98 
 
 
411 aa  213  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  34.27 
 
 
412 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  34.99 
 
 
405 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.72 
 
 
411 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  34.99 
 
 
405 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  34.99 
 
 
405 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  34.02 
 
 
411 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.55 
 
 
411 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  32.28 
 
 
411 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  32.8 
 
 
399 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.02 
 
 
411 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  39.06 
 
 
431 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  37.75 
 
 
390 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  36.58 
 
 
408 aa  209  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  34.66 
 
 
442 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  35.56 
 
 
412 aa  208  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  35.91 
 
 
380 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  37.4 
 
 
417 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  34.16 
 
 
419 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.45 
 
 
411 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  34.24 
 
 
405 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  36.08 
 
 
407 aa  206  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  38.27 
 
 
450 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  34.77 
 
 
400 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.63 
 
 
412 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  33.96 
 
 
395 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  36.39 
 
 
414 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  36.22 
 
 
400 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  34.41 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  34.82 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  32.19 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  35.5 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  31.71 
 
 
410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  34.61 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  34.5 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  34.5 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  36.02 
 
 
418 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  34.79 
 
 
398 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  33.91 
 
 
405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  33.33 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  34.11 
 
 
398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  36.52 
 
 
406 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  33.42 
 
 
396 aa  196  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  33.75 
 
 
417 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  34.49 
 
 
404 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  34.49 
 
 
404 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.96 
 
 
402 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  34.49 
 
 
404 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  32.53 
 
 
398 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  34.09 
 
 
427 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>