More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5035 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  100 
 
 
407 aa  799    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  100 
 
 
407 aa  799    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  99.51 
 
 
407 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  74.45 
 
 
405 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  71.05 
 
 
419 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  42.71 
 
 
402 aa  289  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.4 
 
 
401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  43.84 
 
 
429 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  42.69 
 
 
413 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  42.96 
 
 
423 aa  275  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  40.1 
 
 
412 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  38.28 
 
 
442 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  39.85 
 
 
412 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  42.36 
 
 
405 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  44.8 
 
 
416 aa  266  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  42.33 
 
 
427 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  40.19 
 
 
418 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  42.68 
 
 
414 aa  263  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  39.36 
 
 
411 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  41.48 
 
 
414 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  41.58 
 
 
398 aa  259  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  35.54 
 
 
422 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  38.6 
 
 
405 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  38.65 
 
 
409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  40.83 
 
 
417 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.57 
 
 
399 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  41.46 
 
 
402 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  41.59 
 
 
410 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  40.44 
 
 
417 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.39 
 
 
410 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  39.9 
 
 
419 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  41.21 
 
 
411 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  40.74 
 
 
417 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  34.79 
 
 
420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  39.69 
 
 
417 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  38.16 
 
 
413 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.97 
 
 
417 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.53 
 
 
411 aa  243  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  39.02 
 
 
408 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  38.31 
 
 
407 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  43.03 
 
 
417 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  40.27 
 
 
388 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  39.04 
 
 
468 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  43.16 
 
 
406 aa  239  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  40.58 
 
 
414 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  38.61 
 
 
411 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  36.61 
 
 
417 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.69 
 
 
412 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  40.58 
 
 
392 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  39.65 
 
 
409 aa  236  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.8 
 
 
402 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  37.07 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37.31 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.08 
 
 
426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  42.62 
 
 
450 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  36.83 
 
 
406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  36.97 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  38.89 
 
 
412 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  36.88 
 
 
405 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  37.08 
 
 
415 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  39.24 
 
 
393 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  40.54 
 
 
423 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  38.46 
 
 
411 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  36.78 
 
 
422 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  36.63 
 
 
407 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  39.04 
 
 
400 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  39.18 
 
 
387 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  38.15 
 
 
411 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  37.58 
 
 
411 aa  229  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  38.15 
 
 
411 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  38.58 
 
 
410 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  38.94 
 
 
443 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  38.99 
 
 
393 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  38.35 
 
 
400 aa  229  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  37.85 
 
 
411 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  38.08 
 
 
411 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  39.9 
 
 
430 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  37.27 
 
 
411 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  38.87 
 
 
407 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  37.27 
 
 
411 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  38.08 
 
 
411 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  37.1 
 
 
410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.84 
 
 
409 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  36.69 
 
 
404 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  40.31 
 
 
396 aa  226  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  37.54 
 
 
411 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  38.06 
 
 
439 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  38.58 
 
 
411 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.16 
 
 
412 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  37.35 
 
 
447 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  37.35 
 
 
447 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  37.35 
 
 
447 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  40.34 
 
 
464 aa  223  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  39.66 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  36.83 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  34.05 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  34.95 
 
 
421 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  39.85 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  36.23 
 
 
406 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  33.58 
 
 
396 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>