More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6122 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  100 
 
 
410 aa  835    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  47.93 
 
 
423 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  44.85 
 
 
421 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  41.98 
 
 
398 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  47.72 
 
 
402 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  41.65 
 
 
402 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  47 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  40.36 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  40.41 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  41.07 
 
 
399 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  40.15 
 
 
399 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  43.93 
 
 
405 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  40.36 
 
 
396 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  43.63 
 
 
423 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  45.41 
 
 
411 aa  289  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  41.01 
 
 
420 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  42.23 
 
 
411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  41.89 
 
 
414 aa  285  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  42.21 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  43.28 
 
 
414 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  42.32 
 
 
410 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  44.23 
 
 
411 aa  279  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  43.73 
 
 
405 aa  279  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  41.63 
 
 
429 aa  275  9e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  43.14 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  42.17 
 
 
398 aa  274  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  40.69 
 
 
436 aa  272  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.9 
 
 
412 aa  270  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  39.75 
 
 
411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  40.69 
 
 
426 aa  269  7e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  39.5 
 
 
411 aa  269  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  40.1 
 
 
411 aa  268  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  41.29 
 
 
410 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  40.75 
 
 
408 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  39.6 
 
 
411 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  39.6 
 
 
411 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  39.6 
 
 
411 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  39.35 
 
 
411 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  39.35 
 
 
411 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  40.75 
 
 
411 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  39.35 
 
 
411 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  40.85 
 
 
412 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  42.47 
 
 
417 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  39.05 
 
 
411 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  41.81 
 
 
414 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  41.23 
 
 
408 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  40.56 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  39.76 
 
 
402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  39.39 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  38.83 
 
 
417 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  43.91 
 
 
419 aa  252  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  38.83 
 
 
417 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  37.53 
 
 
406 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  38.13 
 
 
409 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  37 
 
 
407 aa  249  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  41.13 
 
 
400 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  39.39 
 
 
407 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  38.23 
 
 
409 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  39.39 
 
 
407 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  39.39 
 
 
407 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.48 
 
 
407 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  39.25 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  38.23 
 
 
407 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  39.76 
 
 
416 aa  243  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  43.18 
 
 
421 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  39.85 
 
 
409 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  39.6 
 
 
412 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  39.35 
 
 
412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  39.05 
 
 
411 aa  240  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  39.61 
 
 
400 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  39.36 
 
 
427 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  39.35 
 
 
443 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  37.37 
 
 
398 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  38.56 
 
 
410 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  38.59 
 
 
405 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  42.86 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.56 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  40.27 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  37.35 
 
 
405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  37.27 
 
 
405 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  35.88 
 
 
415 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  38.11 
 
 
417 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.69 
 
 
394 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.88 
 
 
419 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  38.65 
 
 
402 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  36.11 
 
 
406 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  38.38 
 
 
417 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  38.56 
 
 
387 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  40.84 
 
 
402 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  40.15 
 
 
450 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  38.7 
 
 
417 aa  226  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  39.16 
 
 
399 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  36.53 
 
 
402 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  34.05 
 
 
422 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  41.06 
 
 
423 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  39.24 
 
 
414 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  39.56 
 
 
423 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  38.99 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  39.79 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  39.01 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>