More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6307 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  100 
 
 
421 aa  868    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  44.85 
 
 
410 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  37.47 
 
 
423 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  37.44 
 
 
400 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  35.29 
 
 
402 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  36.92 
 
 
399 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  35.04 
 
 
402 aa  262  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  35.13 
 
 
398 aa  253  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  37.77 
 
 
414 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  35.53 
 
 
399 aa  247  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  37.5 
 
 
423 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  33.33 
 
 
396 aa  236  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  36.23 
 
 
401 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  37.01 
 
 
427 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.15 
 
 
402 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.93 
 
 
405 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.99 
 
 
399 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  34.78 
 
 
429 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  36.32 
 
 
436 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  34.75 
 
 
411 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  34.95 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.95 
 
 
407 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  34.95 
 
 
407 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35 
 
 
426 aa  219  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  34.57 
 
 
411 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  36 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  34.15 
 
 
400 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.25 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  35.15 
 
 
405 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  36.87 
 
 
402 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  35.95 
 
 
411 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.31 
 
 
400 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  36.05 
 
 
429 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  34.25 
 
 
430 aa  209  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  37.03 
 
 
416 aa  209  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  33.84 
 
 
417 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.73 
 
 
392 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.66 
 
 
411 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  37.78 
 
 
423 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  33.33 
 
 
414 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.66 
 
 
411 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.41 
 
 
411 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  38.5 
 
 
421 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.92 
 
 
411 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.41 
 
 
411 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.41 
 
 
411 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.08 
 
 
411 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.08 
 
 
411 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.43 
 
 
411 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.42 
 
 
411 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  33.59 
 
 
405 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  33.42 
 
 
402 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36 
 
 
412 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  37.85 
 
 
423 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  33.42 
 
 
422 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  30.88 
 
 
410 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  33.33 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  34.69 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  33.09 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.15 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  34.58 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  32.73 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  35.41 
 
 
418 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.91 
 
 
417 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  32.47 
 
 
411 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  35.37 
 
 
418 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  34.17 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  33.33 
 
 
410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  32.22 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.25 
 
 
406 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  35.25 
 
 
409 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  32.47 
 
 
412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  34.66 
 
 
417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.94 
 
 
417 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.9 
 
 
411 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  34.54 
 
 
417 aa  193  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  32.92 
 
 
412 aa  193  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.16 
 
 
405 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  35.66 
 
 
409 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.32 
 
 
409 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  34.27 
 
 
443 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  30.59 
 
 
422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  33.17 
 
 
388 aa  190  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  32.82 
 
 
407 aa  190  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  31.19 
 
 
407 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  33.51 
 
 
404 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  33.33 
 
 
402 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  31.78 
 
 
408 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  32.1 
 
 
395 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.82 
 
 
408 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  34.11 
 
 
404 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  31.74 
 
 
406 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  34.67 
 
 
419 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  32.91 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  33.66 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  35.26 
 
 
414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  32.27 
 
 
396 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3663  cytochrome P450  27.92 
 
 
411 aa  183  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  33.17 
 
 
398 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  33.67 
 
 
410 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>