More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1608 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  100 
 
 		 416 aa  816    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  50.84 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  49.5 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  53.35 
 
 		 414 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  49.75 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  50.13 
 
 		 423 aa  349  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  49.24 
 
 		 427 aa  339  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  45.05 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  44.8 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  44.8 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  43.67 
 
 		 405 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  43.34 
 
 		 419 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  45.12 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.98 
 
 		 402 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  40.68 
 
 		 405 aa  272  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  37.93 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.1 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  40.77 
 
 		 398 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  41.73 
 
 		 413 aa  259  7e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  39.14 
 
 		 411 aa  256  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  42.38 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  38.89 
 
 		 412 aa  253  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  39.71 
 
 		 407 aa  253  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.76 
 
 		 410 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  36.02 
 
 		 422 aa  252  9.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  42.05 
 
 		 409 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  38.89 
 
 		 412 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  39.8 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  38.07 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  40.2 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  38.56 
 
 		 417 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.34 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  34.59 
 
 		 411 aa  243  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  39.86 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  35.09 
 
 		 411 aa  242  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  37.19 
 
 		 408 aa  242  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  42.46 
 
 		 410 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  34.84 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.09 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.09 
 
 		 411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  34.59 
 
 		 411 aa  240  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  34.84 
 
 		 411 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  40 
 
 		 419 aa  239  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  34.84 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  36.74 
 
 		 403 aa  239  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  42.18 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.09 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  39.21 
 
 		 418 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  34.59 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  37.77 
 
 		 426 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  38.74 
 
 		 414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  47.58 
 
 		 402 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  42.64 
 
 		 404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  40.05 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.29 
 
 		 399 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  37.5 
 
 		 410 aa  236  8e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  39.86 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  40.19 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  37.91 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  38.29 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  38.08 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  40.9 
 
 		 464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  38.18 
 
 		 406 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  36.63 
 
 		 412 aa  232  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  40.28 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  40.1 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  37.41 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  40 
 
 		 417 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  37.44 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  34.33 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  38.06 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  38.66 
 
 		 410 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  42.04 
 
 		 421 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  37.7 
 
 		 380 aa  225  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  37.81 
 
 		 400 aa  225  9e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  41.52 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  38.79 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  37.14 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  38.07 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  37.5 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  33.96 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  40.11 
 
 		 396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.92 
 
 		 407 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  37.26 
 
 		 421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  42.6 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  38.15 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  37.62 
 
 		 411 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  43.07 
 
 		 419 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  37.37 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  40.44 
 
 		 450 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  36.02 
 
 		 398 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  36.87 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  43.5 
 
 		 421 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  38.05 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  38.07 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  38.19 
 
 		 405 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  39.6 
 
 		 406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  37.41 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  36.54 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  39.14 
 
 		 396 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>