More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2110 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  100 
 
 
423 aa  834    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  49.39 
 
 
420 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  51.82 
 
 
421 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  46.17 
 
 
422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  44.07 
 
 
412 aa  295  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  40.05 
 
 
411 aa  292  9e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  39.37 
 
 
405 aa  285  9e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  44.76 
 
 
418 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  42.44 
 
 
412 aa  279  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  38.5 
 
 
410 aa  272  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3894  cytochrome P450  44.64 
 
 
403 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  39.52 
 
 
426 aa  269  7e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  42.37 
 
 
419 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  42.49 
 
 
395 aa  268  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  37.56 
 
 
420 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  41.37 
 
 
402 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  37.5 
 
 
411 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.8 
 
 
408 aa  256  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  40.93 
 
 
417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  37.23 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  37.23 
 
 
411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  39.25 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  42.74 
 
 
394 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  36.97 
 
 
411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  38.96 
 
 
395 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  39 
 
 
398 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  36.7 
 
 
411 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.97 
 
 
411 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.97 
 
 
411 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  35.31 
 
 
411 aa  251  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  41.69 
 
 
402 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2116  cytochrome P450  45.04 
 
 
389 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  42.61 
 
 
400 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  37.5 
 
 
411 aa  249  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  35.71 
 
 
411 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  34.12 
 
 
411 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  40.63 
 
 
414 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  40.15 
 
 
399 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  41.08 
 
 
400 aa  245  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  39.6 
 
 
400 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  41.18 
 
 
406 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  41.91 
 
 
398 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.56 
 
 
411 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  41.37 
 
 
401 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  36.32 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  40.71 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  38.44 
 
 
391 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  38.21 
 
 
388 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  40.15 
 
 
398 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  39.86 
 
 
400 aa  229  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  39.41 
 
 
423 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  40.19 
 
 
402 aa  227  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  40.4 
 
 
405 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.51 
 
 
401 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  39.47 
 
 
407 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  39.47 
 
 
407 aa  226  6e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  37.59 
 
 
409 aa  226  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  38.12 
 
 
421 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  39.04 
 
 
412 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.56 
 
 
410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  37.84 
 
 
423 aa  222  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  36.87 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  37.41 
 
 
399 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  39.71 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  37.82 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  40.19 
 
 
416 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  38.97 
 
 
401 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  37.97 
 
 
390 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  37.6 
 
 
404 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  39.52 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  40.06 
 
 
416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  37.56 
 
 
404 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  36.64 
 
 
407 aa  216  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  37.59 
 
 
417 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  38.57 
 
 
429 aa  216  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  43.62 
 
 
367 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  37.7 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  37.01 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  36.18 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  37.5 
 
 
402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  37.43 
 
 
436 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  35.73 
 
 
405 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  36.75 
 
 
409 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  40 
 
 
406 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  40.48 
 
 
395 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  40.18 
 
 
399 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  34.81 
 
 
410 aa  209  8e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  36.71 
 
 
400 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  38.18 
 
 
430 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  35.19 
 
 
429 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  35.61 
 
 
400 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  35.25 
 
 
425 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  35.14 
 
 
417 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  34.43 
 
 
422 aa  207  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  38.07 
 
 
406 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  38.07 
 
 
406 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  38.07 
 
 
406 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  38.52 
 
 
464 aa  206  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  42.2 
 
 
395 aa  206  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  36.3 
 
 
413 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>