More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1816 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  100 
 
 		 415 aa  859    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  61.58 
 
 		 387 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  53.55 
 
 		 393 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  53.55 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  57.29 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  53.32 
 
 		 407 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  48.85 
 
 		 415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  46.94 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  46.17 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  43.18 
 
 		 414 aa  309  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  38.75 
 
 		 405 aa  282  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.54 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  38.73 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  38.29 
 
 		 412 aa  260  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  37.85 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  36.79 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  37.28 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  37.89 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  35.88 
 
 		 410 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  37.08 
 
 		 407 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  37.08 
 
 		 407 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  37.08 
 
 		 407 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  36.92 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3536  cytochrome P450  38.28 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00204069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.62 
 
 		 401 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  36.27 
 
 		 405 aa  219  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  35.31 
 
 		 417 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  34.35 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  34.92 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  36.07 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  36.07 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  36.34 
 
 		 429 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  35.82 
 
 		 447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  34.11 
 
 		 404 aa  212  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.27 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  35.29 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  36.92 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  34.03 
 
 		 398 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  36.08 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  36.08 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35.8 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  34.38 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.42 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.42 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  34.09 
 
 		 413 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  33.77 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.8 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.81 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  31.93 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.77 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  33.25 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  35 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.48 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  37.26 
 
 		 411 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  33.25 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  34.56 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  31.63 
 
 		 410 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  35.43 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  38.23 
 
 		 411 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  33.5 
 
 		 417 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  36.31 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  33.59 
 
 		 406 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  34.66 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  32.34 
 
 		 407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  32.19 
 
 		 422 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  33.76 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  38.14 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  32.88 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  34.26 
 
 		 443 aa  196  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  36.72 
 
 		 411 aa  193  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  30.93 
 
 		 396 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  36.72 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  29.19 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  32.64 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.33 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  34.17 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  32.46 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  35.23 
 
 		 392 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  32.16 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  32.99 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  32.75 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  31.44 
 
 		 407 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  33.33 
 
 		 426 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.2 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  37.8 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  33.07 
 
 		 408 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  33.33 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  36.39 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  34.85 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  31.84 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  32.74 
 
 		 408 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  33.07 
 
 		 399 aa  186  7e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  32.5 
 
 		 464 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  29.6 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.58 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  35.43 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  37.3 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.49 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  32.38 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1904  cytochrome P450  33.33 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>