More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1195 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  100 
 
 
394 aa  783    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  52.64 
 
 
395 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  51.26 
 
 
398 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  47.86 
 
 
395 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  45.24 
 
 
406 aa  295  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  44.88 
 
 
401 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  40.8 
 
 
401 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  41.63 
 
 
403 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  43.89 
 
 
412 aa  283  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  43.91 
 
 
408 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  39.35 
 
 
405 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  42.82 
 
 
406 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  41.18 
 
 
404 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  43.1 
 
 
406 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  43.1 
 
 
406 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  46.17 
 
 
406 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  43.1 
 
 
406 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  42.61 
 
 
403 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  42.25 
 
 
399 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  41.67 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  41.04 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  43.34 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  44.42 
 
 
410 aa  273  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  42.5 
 
 
399 aa  272  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  40.45 
 
 
408 aa  272  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  43.98 
 
 
411 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  42.93 
 
 
398 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  43.47 
 
 
401 aa  265  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  41.48 
 
 
399 aa  264  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  41.42 
 
 
402 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  43.78 
 
 
436 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  42.15 
 
 
400 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  43.36 
 
 
400 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  41.24 
 
 
405 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  41.22 
 
 
391 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  42.71 
 
 
398 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  43.29 
 
 
407 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  43.29 
 
 
407 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  38.92 
 
 
410 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  42.01 
 
 
399 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  39.65 
 
 
393 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  37.47 
 
 
420 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  41.51 
 
 
399 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  42.29 
 
 
409 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  40.35 
 
 
412 aa  255  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  41.04 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  41.94 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  42.74 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  44.06 
 
 
357 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  40.75 
 
 
407 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  41.71 
 
 
425 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.9 
 
 
417 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  37.53 
 
 
409 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  44.63 
 
 
402 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  43.38 
 
 
406 aa  250  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  40.49 
 
 
399 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  40.9 
 
 
408 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  40.68 
 
 
430 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  38.5 
 
 
407 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  42.36 
 
 
400 aa  246  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  39.01 
 
 
409 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  41.81 
 
 
414 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  39.95 
 
 
403 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  37.14 
 
 
411 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  36.29 
 
 
411 aa  242  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  40.55 
 
 
426 aa  242  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  38.29 
 
 
409 aa  242  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  36.29 
 
 
411 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  36.88 
 
 
411 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.82 
 
 
411 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  40.05 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  36.84 
 
 
411 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  36.84 
 
 
411 aa  238  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  40.51 
 
 
402 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  40.05 
 
 
412 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  36.81 
 
 
411 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  41.92 
 
 
418 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  40.65 
 
 
405 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  37.3 
 
 
411 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  39.33 
 
 
400 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  39.52 
 
 
402 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  36.84 
 
 
411 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  36.84 
 
 
411 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  38.42 
 
 
419 aa  235  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  37.53 
 
 
411 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37.44 
 
 
407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  39.19 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  38.27 
 
 
411 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1407  cytochrome P450  39.12 
 
 
388 aa  232  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  39.95 
 
 
423 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  40.64 
 
 
401 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  39.23 
 
 
388 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  38.69 
 
 
410 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  37.25 
 
 
408 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  36.57 
 
 
421 aa  229  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  38.78 
 
 
459 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  39.8 
 
 
404 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  36.99 
 
 
400 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  36.34 
 
 
411 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  41.48 
 
 
414 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>