More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22720 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  100 
 
 
403 aa  815    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  70.15 
 
 
406 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  70.62 
 
 
403 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  69.14 
 
 
404 aa  564  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  65.68 
 
 
401 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  42.61 
 
 
394 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  42.61 
 
 
398 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  39.56 
 
 
425 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  39.51 
 
 
399 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  40.86 
 
 
391 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  39.09 
 
 
402 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  39.53 
 
 
400 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  39.8 
 
 
411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2715  cytochrome P450  38.46 
 
 
393 aa  245  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.475475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  42.75 
 
 
406 aa  244  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.27 
 
 
395 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.34 
 
 
405 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  39.8 
 
 
398 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  39.43 
 
 
426 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  40.87 
 
 
412 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.68 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  37.59 
 
 
402 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  38.98 
 
 
409 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.87 
 
 
401 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  37.69 
 
 
430 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  38.35 
 
 
412 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  38.42 
 
 
401 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  38.21 
 
 
405 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  37.38 
 
 
395 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  36.78 
 
 
404 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  36.76 
 
 
409 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  36.21 
 
 
407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  36.21 
 
 
407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  37.4 
 
 
459 aa  226  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  38.23 
 
 
403 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  35.52 
 
 
408 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  37.32 
 
 
402 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  35.88 
 
 
421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  38.46 
 
 
399 aa  223  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  38.67 
 
 
408 aa  222  8e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5317  cytochrome P450  38.38 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  37.08 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  37.24 
 
 
399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  37.08 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  36.41 
 
 
407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  37.08 
 
 
406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  36.48 
 
 
409 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  37.09 
 
 
408 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  37.02 
 
 
408 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  37.5 
 
 
405 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  36.2 
 
 
400 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  36.5 
 
 
399 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  36.22 
 
 
409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  38.21 
 
 
394 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2614  cytochrome P450  37.75 
 
 
400 aa  216  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  36.39 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  36.67 
 
 
436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.86 
 
 
411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  35.97 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.53 
 
 
400 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  35.84 
 
 
405 aa  213  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.04 
 
 
388 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  36.15 
 
 
406 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  34.68 
 
 
408 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  41.61 
 
 
410 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  36.93 
 
 
410 aa  211  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13141  cytochrome P450 141 cyp141  32.35 
 
 
400 aa  210  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.170339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  36.99 
 
 
410 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  35.07 
 
 
407 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  36.29 
 
 
404 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  36.36 
 
 
416 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  39.38 
 
 
400 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  35.7 
 
 
423 aa  206  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.72 
 
 
399 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  32.58 
 
 
420 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  36.43 
 
 
399 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  41.18 
 
 
357 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  35.29 
 
 
414 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.34 
 
 
400 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  36.16 
 
 
406 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  36.91 
 
 
422 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  38.89 
 
 
345 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  35.35 
 
 
401 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  35.47 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  35.47 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  34.91 
 
 
423 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  33.5 
 
 
419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  35.46 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7442  Cytochrome P450-like protein  35.17 
 
 
571 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  35.2 
 
 
412 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  35.11 
 
 
407 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  34.17 
 
 
411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  34.51 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.84 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  37.5 
 
 
450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  36.3 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  36.12 
 
 
411 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3241  cytochrome P450  34.51 
 
 
415 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5774  cytochrome P450  35.42 
 
 
375 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0682  cytochrome P450  35.7 
 
 
406 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.482648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>