More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2408 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2408  cytochrome P450  100 
 
 		 411 aa  821    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.638834  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  40.45 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  38.27 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  37.47 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2693  cytochrome P450  36.05 
 
 		 395 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0371248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.01 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  39.23 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3361  cytochrome P450  37.83 
 
 		 425 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.529156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  35.25 
 
 		 401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  35.18 
 
 		 404 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3490  cytochrome P450  37.16 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.44 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  36.96 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2103  cytochrome P450  36.1 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  34.5 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  34.5 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  37.11 
 
 		 401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  34.09 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  36.3 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5331  putative cytochrome P450  34.48 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  36.41 
 
 		 400 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4428  cytochrome P450  37.07 
 
 		 401 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  38.8 
 
 		 436 aa  212  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  38.95 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0945  putative cytochrome P450  34.46 
 
 		 410 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1952  cytochrome P450  36.72 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  37.81 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  34.71 
 
 		 426 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.34 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1843  cytochrome P450  36.12 
 
 		 403 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  34.91 
 
 		 398 aa  206  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4934  putative cytochrome P450  36.21 
 
 		 405 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22760  cytochrome P450  35.56 
 
 		 409 aa  206  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  37.08 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  35.08 
 
 		 409 aa  202  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  31.88 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  36.93 
 
 		 418 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  34.78 
 
 		 400 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9048  hypothetical protein  37.67 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  35.46 
 
 		 400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  34.88 
 
 		 423 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1111  cytochrome P450  36.54 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22720  cytochrome P450  36.12 
 
 		 403 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  34.01 
 
 		 400 aa  196  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  39.58 
 
 		 423 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  34.37 
 
 		 409 aa  196  9e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33480  cytochrome P450  33.74 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  37.47 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  40.66 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  34.17 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  37.47 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  34.45 
 
 		 395 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2894  cytochrome P450  34.93 
 
 		 407 aa  192  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  34.13 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  33.89 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.5 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7070  putative cytochrome P450  34.34 
 
 		 408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.83 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  30.58 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2538  cytochrome P450  35.97 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  32.81 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  33.82 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1339  cytochrome P450  35.61 
 
 		 416 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2105  cytochrome P450  33.42 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34341  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  31.87 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2024  cytochrome P450  33.74 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00720801  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2895  cytochrome P450  35.24 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3662  cytochrome P450  35.42 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  33.75 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  31.33 
 
 		 411 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7474  cytochrome P-450  34.9 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884361  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  33.15 
 
 		 410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  33.02 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3840  cytochrome P450  33.02 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  36.1 
 
 		 367 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4419  cytochrome P450  36.13 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  33.02 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4178  cytochrome P450  32.51 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  35.05 
 
 		 398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  32.93 
 
 		 419 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  36.21 
 
 		 421 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4555  putative cytochrome P450  35.08 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268858  normal  0.410272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0688  Cytochrome P450-like protein  36.34 
 
 		 450 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  32.6 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  35.16 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  35.22 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1037  cytochrome P450  32.93 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066208  normal  0.0434723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  37.05 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  35.14 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  37.73 
 
 		 399 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0225  cytochrome P450  33.5 
 
 		 406 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1637  cytochrome P450  32.32 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146914  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2832  cytochrome P450  35.13 
 
 		 402 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.738798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  32.88 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  32.67 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2787  cytochrome P450  30.4 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  32 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5801  cytochrome P450  33.59 
 
 		 395 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0291832  normal  0.365285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  36.13 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  31.04 
 
 		 408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>